Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX8Q9Y5X2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX8Q9Y5X2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX8Q9Y5X2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX8Q9Y5X2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX8Q9Y5X2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX8Q9Y5X2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX8Q9Y5X2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX8Q9Y5X2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX8Q9Y5X2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX8Q9Y5X2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX8Q9Y5X2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX8Q9Y5X2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX8Q9Y5X2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX8Q9Y5X2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX8Q9Y5X2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX8Q9Y5X2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX8Q9Y5X2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX8Q9Y5X2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX8Q9Y5X2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX8Q9Y5X2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX8Q9Y5X2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX8Q9Y5X2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX8Q9Y5X2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX8Q9Y5X2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX8Q9Y5X2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX8Q9Y5X2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX8Q9Y5X2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX8Q9Y5X2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX8Q9Y5X2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX8Q9Y5X2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX8Q9Y5X2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX8Q9Y5X2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX8Q9Y5X2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX8Q9Y5X2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX8Q9Y5X2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX8Q9Y5X2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX8Q9Y5X2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX8Q9Y5X2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX8Q9Y5X2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX8Q9Y5X2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX8Q9Y5X2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX8Q9Y5X2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX8Q9Y5X2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX8Q9Y5X2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX8Q9Y5X2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX8Q9Y5X2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX8Q9Y5X2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX8Q9Y5X2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX8Q9Y5X2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX8Q9Y5X2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX8Q9Y5X2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNX8Q9Y5X2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX8Q9Y5X2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX8Q9Y5X2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX8Q9Y5X2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX8Q9Y5X2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX8Q9Y5X2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX8Q9Y5X2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX8Q9Y5X2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX8Q9Y5X2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX8Q9Y5X2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX8Q9Y5X2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX8Q9Y5X2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX8Q9Y5X2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX8Q9Y5X2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX8Q9Y5X2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX8Q9Y5X2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX8Q9Y5X2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX8Q9Y5X2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX8Q9Y5X2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX8Q9Y5X2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX8Q9Y5X2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX8Q9Y5X2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX8Q9Y5X2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX8Q9Y5X2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX8Q9Y5X2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX8Q9Y5X2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX8Q9Y5X2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX8Q9Y5X2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX8Q9Y5X2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX8Q9Y5X2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX8Q9Y5X2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX8Q9Y5X2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX8Q9Y5X2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX8Q9Y5X2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX8Q9Y5X2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX8Q9Y5X2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX8Q9Y5X2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX8Q9Y5X2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX8Q9Y5X2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX8Q9Y5X2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX8Q9Y5X2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX8Q9Y5X2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX8Q9Y5X2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX8Q9Y5X2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX8Q9Y5X2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX8Q9Y5X2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX8Q9Y5X2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX8Q9Y5X2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 193.9 ms