Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E6

PCDHB3, Protocadherin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB3Q9Y5E6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHB3Q9Y5E6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHB3Q9Y5E6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHB3Q9Y5E6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB3Q9Y5E6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB3Q9Y5E6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB3Q9Y5E6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB3Q9Y5E6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB3Q9Y5E6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB3Q9Y5E6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB3Q9Y5E6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB3Q9Y5E6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB3Q9Y5E6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB3Q9Y5E6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB3Q9Y5E6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB3Q9Y5E6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB3Q9Y5E6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB3Q9Y5E6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB3Q9Y5E6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB3Q9Y5E6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB3Q9Y5E6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB3Q9Y5E6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB3Q9Y5E6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB3Q9Y5E6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHB3Q9Y5E6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHB3Q9Y5E6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHB3Q9Y5E6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHB3Q9Y5E6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHB3Q9Y5E6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHB3Q9Y5E6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHB3Q9Y5E6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHB3Q9Y5E6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHB3Q9Y5E6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHB3Q9Y5E6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHB3Q9Y5E6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHB3Q9Y5E6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHB3Q9Y5E6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHB3Q9Y5E6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB3Q9Y5E6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB3Q9Y5E6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB3Q9Y5E6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB3Q9Y5E6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB3Q9Y5E6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB3Q9Y5E6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB3Q9Y5E6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB3Q9Y5E6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB3Q9Y5E6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB3Q9Y5E6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB3Q9Y5E6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB3Q9Y5E6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB3Q9Y5E6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB3Q9Y5E6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHB3Q9Y5E6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHB3Q9Y5E6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHB3Q9Y5E6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHB3Q9Y5E6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHB3Q9Y5E6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHB3Q9Y5E6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHB3Q9Y5E6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHB3Q9Y5E6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHB3Q9Y5E6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHB3Q9Y5E6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB3Q9Y5E6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB3Q9Y5E6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB3Q9Y5E6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB3Q9Y5E6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB3Q9Y5E6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB3Q9Y5E6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB3Q9Y5E6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB3Q9Y5E6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB3Q9Y5E6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB3Q9Y5E6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB3Q9Y5E6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB3Q9Y5E6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB3Q9Y5E6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PCDHB3Q9Y5E6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHB3Q9Y5E6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHB3Q9Y5E6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHB3Q9Y5E6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHB3Q9Y5E6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHB3Q9Y5E6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHB3Q9Y5E6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHB3Q9Y5E6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHB3Q9Y5E6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHB3Q9Y5E6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB3Q9Y5E6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB3Q9Y5E6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB3Q9Y5E6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB3Q9Y5E6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB3Q9Y5E6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB3Q9Y5E6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB3Q9Y5E6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB3Q9Y5E6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB3Q9Y5E6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB3Q9Y5E6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB3Q9Y5E6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB3Q9Y5E6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHB3Q9Y5E6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB3Q9Y5E6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB3Q9Y5E6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms