Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5C1

ANGPTL3, Angiopoietin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANGPTL3Q9Y5C1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ANGPTL3Q9Y5C1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ANGPTL3Q9Y5C1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ANGPTL3Q9Y5C1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ANGPTL3Q9Y5C1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ANGPTL3Q9Y5C1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ANGPTL3Q9Y5C1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ANGPTL3Q9Y5C1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ANGPTL3Q9Y5C1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ANGPTL3Q9Y5C1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ANGPTL3Q9Y5C1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ANGPTL3Q9Y5C1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ANGPTL3Q9Y5C1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ANGPTL3Q9Y5C1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ANGPTL3Q9Y5C1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ANGPTL3Q9Y5C1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ANGPTL3Q9Y5C1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ANGPTL3Q9Y5C1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ANGPTL3Q9Y5C1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ANGPTL3Q9Y5C1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ANGPTL3Q9Y5C1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ANGPTL3Q9Y5C1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ANGPTL3Q9Y5C1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ANGPTL3Q9Y5C1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ANGPTL3Q9Y5C1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ANGPTL3Q9Y5C1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ANGPTL3Q9Y5C1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ANGPTL3Q9Y5C1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ANGPTL3Q9Y5C1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ANGPTL3Q9Y5C1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ANGPTL3Q9Y5C1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ANGPTL3Q9Y5C1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ANGPTL3Q9Y5C1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ANGPTL3Q9Y5C1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ANGPTL3Q9Y5C1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ANGPTL3Q9Y5C1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ANGPTL3Q9Y5C1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ANGPTL3Q9Y5C1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ANGPTL3Q9Y5C1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ANGPTL3Q9Y5C1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ANGPTL3Q9Y5C1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ANGPTL3Q9Y5C1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ANGPTL3Q9Y5C1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ANGPTL3Q9Y5C1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ANGPTL3Q9Y5C1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ANGPTL3Q9Y5C1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ANGPTL3Q9Y5C1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ANGPTL3Q9Y5C1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ANGPTL3Q9Y5C1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ANGPTL3Q9Y5C1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ANGPTL3Q9Y5C1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ANGPTL3Q9Y5C1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ANGPTL3Q9Y5C1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ANGPTL3Q9Y5C1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ANGPTL3Q9Y5C1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ANGPTL3Q9Y5C1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ANGPTL3Q9Y5C1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ANGPTL3Q9Y5C1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ANGPTL3Q9Y5C1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ANGPTL3Q9Y5C1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ANGPTL3Q9Y5C1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ANGPTL3Q9Y5C1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ANGPTL3Q9Y5C1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ANGPTL3Q9Y5C1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ANGPTL3Q9Y5C1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ANGPTL3Q9Y5C1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ANGPTL3Q9Y5C1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ANGPTL3Q9Y5C1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ANGPTL3Q9Y5C1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ANGPTL3Q9Y5C1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ANGPTL3Q9Y5C1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ANGPTL3Q9Y5C1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ANGPTL3Q9Y5C1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ANGPTL3Q9Y5C1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ANGPTL3Q9Y5C1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ANGPTL3Q9Y5C1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ANGPTL3Q9Y5C1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ANGPTL3Q9Y5C1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ANGPTL3Q9Y5C1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ANGPTL3Q9Y5C1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ANGPTL3Q9Y5C1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ANGPTL3Q9Y5C1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ANGPTL3Q9Y5C1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ANGPTL3Q9Y5C1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ANGPTL3Q9Y5C1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ANGPTL3Q9Y5C1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ANGPTL3Q9Y5C1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ANGPTL3Q9Y5C1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ANGPTL3Q9Y5C1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ANGPTL3Q9Y5C1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ANGPTL3Q9Y5C1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ANGPTL3Q9Y5C1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ANGPTL3Q9Y5C1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ANGPTL3Q9Y5C1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANGPTL3Q9Y5C1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANGPTL3Q9Y5C1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANGPTL3Q9Y5C1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANGPTL3Q9Y5C1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ANGPTL3Q9Y5C1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ANGPTL3Q9Y5C1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms