Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NFE2L3Q9Y4A8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NFE2L3Q9Y4A8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NFE2L3Q9Y4A8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NFE2L3Q9Y4A8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NFE2L3Q9Y4A8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NFE2L3Q9Y4A8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NFE2L3Q9Y4A8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NFE2L3Q9Y4A8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NFE2L3Q9Y4A8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NFE2L3Q9Y4A8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NFE2L3Q9Y4A8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NFE2L3Q9Y4A8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NFE2L3Q9Y4A8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NFE2L3Q9Y4A8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NFE2L3Q9Y4A8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NFE2L3Q9Y4A8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NFE2L3Q9Y4A8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NFE2L3Q9Y4A8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NFE2L3Q9Y4A8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NFE2L3Q9Y4A8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NFE2L3Q9Y4A8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NFE2L3Q9Y4A8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NFE2L3Q9Y4A8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NFE2L3Q9Y4A8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NFE2L3Q9Y4A8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NFE2L3Q9Y4A8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NFE2L3Q9Y4A8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NFE2L3Q9Y4A8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NFE2L3Q9Y4A8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NFE2L3Q9Y4A8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NFE2L3Q9Y4A8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
NFE2L3Q9Y4A8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NFE2L3Q9Y4A8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NFE2L3Q9Y4A8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NFE2L3Q9Y4A8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NFE2L3Q9Y4A8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NFE2L3Q9Y4A8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NFE2L3Q9Y4A8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NFE2L3Q9Y4A8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NFE2L3Q9Y4A8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.51■■■□□ 2
NFE2L3Q9Y4A8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NFE2L3Q9Y4A8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NFE2L3Q9Y4A8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NFE2L3Q9Y4A8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NFE2L3Q9Y4A8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NFE2L3Q9Y4A8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NFE2L3Q9Y4A8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NFE2L3Q9Y4A8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NFE2L3Q9Y4A8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NFE2L3Q9Y4A8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NFE2L3Q9Y4A8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NFE2L3Q9Y4A8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NFE2L3Q9Y4A8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NFE2L3Q9Y4A8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFE2L3Q9Y4A8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFE2L3Q9Y4A8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFE2L3Q9Y4A8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFE2L3Q9Y4A8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NFE2L3Q9Y4A8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFE2L3Q9Y4A8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NFE2L3Q9Y4A8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NFE2L3Q9Y4A8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NFE2L3Q9Y4A8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NFE2L3Q9Y4A8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NFE2L3Q9Y4A8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NFE2L3Q9Y4A8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NFE2L3Q9Y4A8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NFE2L3Q9Y4A8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NFE2L3Q9Y4A8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NFE2L3Q9Y4A8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NFE2L3Q9Y4A8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NFE2L3Q9Y4A8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NFE2L3Q9Y4A8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NFE2L3Q9Y4A8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NFE2L3Q9Y4A8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NFE2L3Q9Y4A8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NFE2L3Q9Y4A8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NFE2L3Q9Y4A8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NFE2L3Q9Y4A8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NFE2L3Q9Y4A8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NFE2L3Q9Y4A8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NFE2L3Q9Y4A8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NFE2L3Q9Y4A8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NFE2L3Q9Y4A8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NFE2L3Q9Y4A8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NFE2L3Q9Y4A8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NFE2L3Q9Y4A8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NFE2L3Q9Y4A8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NFE2L3Q9Y4A8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NFE2L3Q9Y4A8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NFE2L3Q9Y4A8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NFE2L3Q9Y4A8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NFE2L3Q9Y4A8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NFE2L3Q9Y4A8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NFE2L3Q9Y4A8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NFE2L3Q9Y4A8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NFE2L3Q9Y4A8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NFE2L3Q9Y4A8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NFE2L3Q9Y4A8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms