Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NFE2L3Q9Y4A8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NFE2L3Q9Y4A8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NFE2L3Q9Y4A8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NFE2L3Q9Y4A8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NFE2L3Q9Y4A8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NFE2L3Q9Y4A8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NFE2L3Q9Y4A8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NFE2L3Q9Y4A8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NFE2L3Q9Y4A8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NFE2L3Q9Y4A8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NFE2L3Q9Y4A8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NFE2L3Q9Y4A8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NFE2L3Q9Y4A8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NFE2L3Q9Y4A8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NFE2L3Q9Y4A8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NFE2L3Q9Y4A8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NFE2L3Q9Y4A8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NFE2L3Q9Y4A8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NFE2L3Q9Y4A8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NFE2L3Q9Y4A8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NFE2L3Q9Y4A8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NFE2L3Q9Y4A8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NFE2L3Q9Y4A8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NFE2L3Q9Y4A8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NFE2L3Q9Y4A8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NFE2L3Q9Y4A8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NFE2L3Q9Y4A8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NFE2L3Q9Y4A8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NFE2L3Q9Y4A8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NFE2L3Q9Y4A8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NFE2L3Q9Y4A8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
NFE2L3Q9Y4A8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NFE2L3Q9Y4A8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NFE2L3Q9Y4A8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NFE2L3Q9Y4A8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NFE2L3Q9Y4A8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NFE2L3Q9Y4A8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NFE2L3Q9Y4A8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NFE2L3Q9Y4A8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NFE2L3Q9Y4A8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.51■■■□□ 2
NFE2L3Q9Y4A8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NFE2L3Q9Y4A8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NFE2L3Q9Y4A8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NFE2L3Q9Y4A8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NFE2L3Q9Y4A8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NFE2L3Q9Y4A8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NFE2L3Q9Y4A8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NFE2L3Q9Y4A8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NFE2L3Q9Y4A8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NFE2L3Q9Y4A8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NFE2L3Q9Y4A8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NFE2L3Q9Y4A8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NFE2L3Q9Y4A8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NFE2L3Q9Y4A8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFE2L3Q9Y4A8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFE2L3Q9Y4A8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFE2L3Q9Y4A8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFE2L3Q9Y4A8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NFE2L3Q9Y4A8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NFE2L3Q9Y4A8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NFE2L3Q9Y4A8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NFE2L3Q9Y4A8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NFE2L3Q9Y4A8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NFE2L3Q9Y4A8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NFE2L3Q9Y4A8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NFE2L3Q9Y4A8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NFE2L3Q9Y4A8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NFE2L3Q9Y4A8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NFE2L3Q9Y4A8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NFE2L3Q9Y4A8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NFE2L3Q9Y4A8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NFE2L3Q9Y4A8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NFE2L3Q9Y4A8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NFE2L3Q9Y4A8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NFE2L3Q9Y4A8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NFE2L3Q9Y4A8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NFE2L3Q9Y4A8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NFE2L3Q9Y4A8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NFE2L3Q9Y4A8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NFE2L3Q9Y4A8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NFE2L3Q9Y4A8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NFE2L3Q9Y4A8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NFE2L3Q9Y4A8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NFE2L3Q9Y4A8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NFE2L3Q9Y4A8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NFE2L3Q9Y4A8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NFE2L3Q9Y4A8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NFE2L3Q9Y4A8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NFE2L3Q9Y4A8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NFE2L3Q9Y4A8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NFE2L3Q9Y4A8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NFE2L3Q9Y4A8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NFE2L3Q9Y4A8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NFE2L3Q9Y4A8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NFE2L3Q9Y4A8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NFE2L3Q9Y4A8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NFE2L3Q9Y4A8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NFE2L3Q9Y4A8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NFE2L3Q9Y4A8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms