Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KIF3AQ9Y496 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KIF3AQ9Y496 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KIF3AQ9Y496 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KIF3AQ9Y496 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KIF3AQ9Y496 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KIF3AQ9Y496 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KIF3AQ9Y496 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KIF3AQ9Y496 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KIF3AQ9Y496 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KIF3AQ9Y496 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KIF3AQ9Y496 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KIF3AQ9Y496 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KIF3AQ9Y496 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KIF3AQ9Y496 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
KIF3AQ9Y496 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KIF3AQ9Y496 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KIF3AQ9Y496 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
KIF3AQ9Y496 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
KIF3AQ9Y496 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KIF3AQ9Y496 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KIF3AQ9Y496 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
KIF3AQ9Y496 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
KIF3AQ9Y496 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KIF3AQ9Y496 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KIF3AQ9Y496 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KIF3AQ9Y496 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KIF3AQ9Y496 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KIF3AQ9Y496 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KIF3AQ9Y496 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KIF3AQ9Y496 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KIF3AQ9Y496 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KIF3AQ9Y496 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KIF3AQ9Y496 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KIF3AQ9Y496 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
KIF3AQ9Y496 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KIF3AQ9Y496 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KIF3AQ9Y496 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KIF3AQ9Y496 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KIF3AQ9Y496 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KIF3AQ9Y496 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KIF3AQ9Y496 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
KIF3AQ9Y496 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
KIF3AQ9Y496 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
KIF3AQ9Y496 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KIF3AQ9Y496 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KIF3AQ9Y496 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KIF3AQ9Y496 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KIF3AQ9Y496 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KIF3AQ9Y496 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
KIF3AQ9Y496 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KIF3AQ9Y496 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KIF3AQ9Y496 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KIF3AQ9Y496 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KIF3AQ9Y496 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KIF3AQ9Y496 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KIF3AQ9Y496 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KIF3AQ9Y496 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KIF3AQ9Y496 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KIF3AQ9Y496 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KIF3AQ9Y496 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KIF3AQ9Y496 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KIF3AQ9Y496 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
KIF3AQ9Y496 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
KIF3AQ9Y496 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KIF3AQ9Y496 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KIF3AQ9Y496 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KIF3AQ9Y496 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KIF3AQ9Y496 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KIF3AQ9Y496 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
KIF3AQ9Y496 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KIF3AQ9Y496 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KIF3AQ9Y496 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KIF3AQ9Y496 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KIF3AQ9Y496 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KIF3AQ9Y496 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KIF3AQ9Y496 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KIF3AQ9Y496 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KIF3AQ9Y496 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KIF3AQ9Y496 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KIF3AQ9Y496 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KIF3AQ9Y496 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
KIF3AQ9Y496 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
KIF3AQ9Y496 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
KIF3AQ9Y496 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
KIF3AQ9Y496 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
KIF3AQ9Y496 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
KIF3AQ9Y496 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
KIF3AQ9Y496 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
KIF3AQ9Y496 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
KIF3AQ9Y496 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KIF3AQ9Y496 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KIF3AQ9Y496 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KIF3AQ9Y496 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KIF3AQ9Y496 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KIF3AQ9Y496 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KIF3AQ9Y496 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KIF3AQ9Y496 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KIF3AQ9Y496 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KIF3AQ9Y496 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms