Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B8

REXO2, Oligoribonuclease, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO2Q9Y3B8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
REXO2Q9Y3B8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
REXO2Q9Y3B8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
REXO2Q9Y3B8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
REXO2Q9Y3B8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
REXO2Q9Y3B8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
REXO2Q9Y3B8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
REXO2Q9Y3B8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
REXO2Q9Y3B8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
REXO2Q9Y3B8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
REXO2Q9Y3B8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
REXO2Q9Y3B8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
REXO2Q9Y3B8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
REXO2Q9Y3B8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
REXO2Q9Y3B8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
REXO2Q9Y3B8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
REXO2Q9Y3B8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
REXO2Q9Y3B8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
REXO2Q9Y3B8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
REXO2Q9Y3B8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
REXO2Q9Y3B8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
REXO2Q9Y3B8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
REXO2Q9Y3B8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
REXO2Q9Y3B8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
REXO2Q9Y3B8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
REXO2Q9Y3B8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
REXO2Q9Y3B8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
REXO2Q9Y3B8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
REXO2Q9Y3B8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
REXO2Q9Y3B8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
REXO2Q9Y3B8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
REXO2Q9Y3B8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
REXO2Q9Y3B8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
REXO2Q9Y3B8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
REXO2Q9Y3B8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
REXO2Q9Y3B8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
REXO2Q9Y3B8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
REXO2Q9Y3B8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
REXO2Q9Y3B8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
REXO2Q9Y3B8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
REXO2Q9Y3B8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
REXO2Q9Y3B8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
REXO2Q9Y3B8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
REXO2Q9Y3B8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
REXO2Q9Y3B8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
REXO2Q9Y3B8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
REXO2Q9Y3B8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
REXO2Q9Y3B8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
REXO2Q9Y3B8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
REXO2Q9Y3B8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
REXO2Q9Y3B8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
REXO2Q9Y3B8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
REXO2Q9Y3B8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
REXO2Q9Y3B8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
REXO2Q9Y3B8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
REXO2Q9Y3B8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
REXO2Q9Y3B8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
REXO2Q9Y3B8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
REXO2Q9Y3B8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
REXO2Q9Y3B8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
REXO2Q9Y3B8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
REXO2Q9Y3B8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
REXO2Q9Y3B8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
REXO2Q9Y3B8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
REXO2Q9Y3B8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
REXO2Q9Y3B8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
REXO2Q9Y3B8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
REXO2Q9Y3B8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
REXO2Q9Y3B8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
REXO2Q9Y3B8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
REXO2Q9Y3B8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
REXO2Q9Y3B8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
REXO2Q9Y3B8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
REXO2Q9Y3B8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
REXO2Q9Y3B8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
REXO2Q9Y3B8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
REXO2Q9Y3B8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
REXO2Q9Y3B8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
REXO2Q9Y3B8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
REXO2Q9Y3B8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
REXO2Q9Y3B8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
REXO2Q9Y3B8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
REXO2Q9Y3B8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
REXO2Q9Y3B8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
REXO2Q9Y3B8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
REXO2Q9Y3B8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
REXO2Q9Y3B8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
REXO2Q9Y3B8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
REXO2Q9Y3B8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
REXO2Q9Y3B8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
REXO2Q9Y3B8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
REXO2Q9Y3B8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
REXO2Q9Y3B8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
REXO2Q9Y3B8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
REXO2Q9Y3B8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
REXO2Q9Y3B8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
REXO2Q9Y3B8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
REXO2Q9Y3B8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
REXO2Q9Y3B8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
REXO2Q9Y3B8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms