Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A6

TMED5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED5Q9Y3A6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMED5Q9Y3A6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMED5Q9Y3A6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMED5Q9Y3A6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMED5Q9Y3A6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMED5Q9Y3A6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMED5Q9Y3A6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMED5Q9Y3A6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMED5Q9Y3A6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMED5Q9Y3A6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMED5Q9Y3A6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMED5Q9Y3A6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMED5Q9Y3A6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMED5Q9Y3A6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMED5Q9Y3A6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMED5Q9Y3A6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMED5Q9Y3A6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMED5Q9Y3A6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMED5Q9Y3A6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMED5Q9Y3A6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMED5Q9Y3A6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMED5Q9Y3A6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMED5Q9Y3A6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMED5Q9Y3A6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMED5Q9Y3A6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMED5Q9Y3A6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMED5Q9Y3A6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMED5Q9Y3A6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMED5Q9Y3A6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMED5Q9Y3A6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMED5Q9Y3A6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMED5Q9Y3A6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMED5Q9Y3A6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMED5Q9Y3A6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMED5Q9Y3A6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMED5Q9Y3A6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMED5Q9Y3A6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TMED5Q9Y3A6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMED5Q9Y3A6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMED5Q9Y3A6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMED5Q9Y3A6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMED5Q9Y3A6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMED5Q9Y3A6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMED5Q9Y3A6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMED5Q9Y3A6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMED5Q9Y3A6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMED5Q9Y3A6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMED5Q9Y3A6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMED5Q9Y3A6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMED5Q9Y3A6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMED5Q9Y3A6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMED5Q9Y3A6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMED5Q9Y3A6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMED5Q9Y3A6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TMED5Q9Y3A6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMED5Q9Y3A6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TMED5Q9Y3A6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMED5Q9Y3A6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMED5Q9Y3A6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMED5Q9Y3A6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TMED5Q9Y3A6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMED5Q9Y3A6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMED5Q9Y3A6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMED5Q9Y3A6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMED5Q9Y3A6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMED5Q9Y3A6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMED5Q9Y3A6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMED5Q9Y3A6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TMED5Q9Y3A6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMED5Q9Y3A6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMED5Q9Y3A6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMED5Q9Y3A6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMED5Q9Y3A6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMED5Q9Y3A6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TMED5Q9Y3A6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
TMED5Q9Y3A6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TMED5Q9Y3A6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMED5Q9Y3A6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMED5Q9Y3A6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMED5Q9Y3A6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMED5Q9Y3A6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMED5Q9Y3A6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMED5Q9Y3A6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMED5Q9Y3A6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMED5Q9Y3A6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMED5Q9Y3A6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMED5Q9Y3A6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMED5Q9Y3A6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMED5Q9Y3A6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMED5Q9Y3A6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMED5Q9Y3A6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMED5Q9Y3A6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMED5Q9Y3A6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMED5Q9Y3A6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMED5Q9Y3A6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMED5Q9Y3A6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TMED5Q9Y3A6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMED5Q9Y3A6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMED5Q9Y3A6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMED5Q9Y3A6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.9 ms