Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTNND2Q9UQB3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTNND2Q9UQB3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTNND2Q9UQB3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTNND2Q9UQB3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CTNND2Q9UQB3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTNND2Q9UQB3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTNND2Q9UQB3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTNND2Q9UQB3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTNND2Q9UQB3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CTNND2Q9UQB3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTNND2Q9UQB3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTNND2Q9UQB3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTNND2Q9UQB3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTNND2Q9UQB3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTNND2Q9UQB3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTNND2Q9UQB3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTNND2Q9UQB3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTNND2Q9UQB3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTNND2Q9UQB3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTNND2Q9UQB3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTNND2Q9UQB3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTNND2Q9UQB3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.58■■■□□ 2
CTNND2Q9UQB3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CTNND2Q9UQB3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CTNND2Q9UQB3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CTNND2Q9UQB3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CTNND2Q9UQB3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CTNND2Q9UQB3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CTNND2Q9UQB3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTNND2Q9UQB3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CTNND2Q9UQB3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CTNND2Q9UQB3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
CTNND2Q9UQB3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CTNND2Q9UQB3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CTNND2Q9UQB3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CTNND2Q9UQB3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CTNND2Q9UQB3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CTNND2Q9UQB3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CTNND2Q9UQB3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTNND2Q9UQB3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTNND2Q9UQB3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTNND2Q9UQB3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTNND2Q9UQB3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTNND2Q9UQB3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTNND2Q9UQB3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTNND2Q9UQB3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTNND2Q9UQB3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTNND2Q9UQB3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTNND2Q9UQB3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTNND2Q9UQB3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTNND2Q9UQB3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTNND2Q9UQB3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CTNND2Q9UQB3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
CTNND2Q9UQB3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTNND2Q9UQB3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTNND2Q9UQB3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTNND2Q9UQB3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTNND2Q9UQB3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTNND2Q9UQB3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTNND2Q9UQB3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTNND2Q9UQB3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTNND2Q9UQB3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTNND2Q9UQB3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTNND2Q9UQB3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTNND2Q9UQB3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTNND2Q9UQB3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTNND2Q9UQB3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTNND2Q9UQB3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTNND2Q9UQB3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTNND2Q9UQB3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTNND2Q9UQB3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTNND2Q9UQB3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTNND2Q9UQB3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTNND2Q9UQB3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTNND2Q9UQB3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTNND2Q9UQB3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTNND2Q9UQB3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTNND2Q9UQB3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTNND2Q9UQB3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTNND2Q9UQB3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTNND2Q9UQB3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CTNND2Q9UQB3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CTNND2Q9UQB3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CTNND2Q9UQB3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CTNND2Q9UQB3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CTNND2Q9UQB3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CTNND2Q9UQB3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CTNND2Q9UQB3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CTNND2Q9UQB3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTNND2Q9UQB3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTNND2Q9UQB3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTNND2Q9UQB3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTNND2Q9UQB3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTNND2Q9UQB3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTNND2Q9UQB3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTNND2Q9UQB3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTNND2Q9UQB3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTNND2Q9UQB3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTNND2Q9UQB3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms