Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU5

USP24, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 24, humanhuman

Predictions only

Length 2,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP24Q9UPU5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP24Q9UPU5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP24Q9UPU5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
USP24Q9UPU5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP24Q9UPU5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP24Q9UPU5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP24Q9UPU5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP24Q9UPU5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP24Q9UPU5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
USP24Q9UPU5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP24Q9UPU5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP24Q9UPU5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP24Q9UPU5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
USP24Q9UPU5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP24Q9UPU5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP24Q9UPU5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP24Q9UPU5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP24Q9UPU5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP24Q9UPU5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP24Q9UPU5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP24Q9UPU5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
USP24Q9UPU5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP24Q9UPU5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP24Q9UPU5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP24Q9UPU5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP24Q9UPU5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP24Q9UPU5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP24Q9UPU5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP24Q9UPU5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP24Q9UPU5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP24Q9UPU5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP24Q9UPU5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP24Q9UPU5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP24Q9UPU5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP24Q9UPU5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP24Q9UPU5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP24Q9UPU5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP24Q9UPU5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP24Q9UPU5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP24Q9UPU5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP24Q9UPU5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP24Q9UPU5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP24Q9UPU5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP24Q9UPU5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP24Q9UPU5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP24Q9UPU5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP24Q9UPU5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP24Q9UPU5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP24Q9UPU5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP24Q9UPU5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP24Q9UPU5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP24Q9UPU5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP24Q9UPU5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP24Q9UPU5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP24Q9UPU5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP24Q9UPU5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP24Q9UPU5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP24Q9UPU5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP24Q9UPU5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP24Q9UPU5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP24Q9UPU5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP24Q9UPU5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP24Q9UPU5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP24Q9UPU5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP24Q9UPU5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP24Q9UPU5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
USP24Q9UPU5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP24Q9UPU5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP24Q9UPU5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP24Q9UPU5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP24Q9UPU5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
USP24Q9UPU5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP24Q9UPU5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP24Q9UPU5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP24Q9UPU5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP24Q9UPU5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP24Q9UPU5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP24Q9UPU5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP24Q9UPU5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP24Q9UPU5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP24Q9UPU5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP24Q9UPU5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
USP24Q9UPU5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP24Q9UPU5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP24Q9UPU5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP24Q9UPU5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP24Q9UPU5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP24Q9UPU5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP24Q9UPU5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP24Q9UPU5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP24Q9UPU5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
USP24Q9UPU5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP24Q9UPU5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP24Q9UPU5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP24Q9UPU5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP24Q9UPU5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP24Q9UPU5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP24Q9UPU5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP24Q9UPU5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
USP24Q9UPU5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms