Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
L1RE1Q9UN81 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
L1RE1Q9UN81 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
L1RE1Q9UN81 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
L1RE1Q9UN81 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
L1RE1Q9UN81 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
L1RE1Q9UN81 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
L1RE1Q9UN81 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
L1RE1Q9UN81 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
L1RE1Q9UN81 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
L1RE1Q9UN81 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
L1RE1Q9UN81 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
L1RE1Q9UN81 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
L1RE1Q9UN81 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
L1RE1Q9UN81 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
L1RE1Q9UN81 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
L1RE1Q9UN81 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
L1RE1Q9UN81 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
L1RE1Q9UN81 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
L1RE1Q9UN81 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
L1RE1Q9UN81 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
L1RE1Q9UN81 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
L1RE1Q9UN81 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
L1RE1Q9UN81 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
L1RE1Q9UN81 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
L1RE1Q9UN81 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
L1RE1Q9UN81 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
L1RE1Q9UN81 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
L1RE1Q9UN81 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
L1RE1Q9UN81 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
L1RE1Q9UN81 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
L1RE1Q9UN81 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
L1RE1Q9UN81 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
L1RE1Q9UN81 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
L1RE1Q9UN81 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
L1RE1Q9UN81 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
L1RE1Q9UN81 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
L1RE1Q9UN81 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
L1RE1Q9UN81 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
L1RE1Q9UN81 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
L1RE1Q9UN81 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
L1RE1Q9UN81 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
L1RE1Q9UN81 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
L1RE1Q9UN81 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
L1RE1Q9UN81 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
L1RE1Q9UN81 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
L1RE1Q9UN81 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
L1RE1Q9UN81 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
L1RE1Q9UN81 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
L1RE1Q9UN81 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
L1RE1Q9UN81 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
L1RE1Q9UN81 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
L1RE1Q9UN81 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
L1RE1Q9UN81 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
L1RE1Q9UN81 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
L1RE1Q9UN81 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
L1RE1Q9UN81 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
L1RE1Q9UN81 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
L1RE1Q9UN81 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
L1RE1Q9UN81 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
L1RE1Q9UN81 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
L1RE1Q9UN81 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
L1RE1Q9UN81 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
L1RE1Q9UN81 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
L1RE1Q9UN81 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
L1RE1Q9UN81 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
L1RE1Q9UN81 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
L1RE1Q9UN81 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
L1RE1Q9UN81 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
L1RE1Q9UN81 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
L1RE1Q9UN81 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
L1RE1Q9UN81 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
L1RE1Q9UN81 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
L1RE1Q9UN81 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
L1RE1Q9UN81 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
L1RE1Q9UN81 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
L1RE1Q9UN81 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
L1RE1Q9UN81 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
L1RE1Q9UN81 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
L1RE1Q9UN81 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
L1RE1Q9UN81 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
L1RE1Q9UN81 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
L1RE1Q9UN81 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
L1RE1Q9UN81 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
L1RE1Q9UN81 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
L1RE1Q9UN81 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
L1RE1Q9UN81 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
L1RE1Q9UN81 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
L1RE1Q9UN81 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
L1RE1Q9UN81 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
L1RE1Q9UN81 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
L1RE1Q9UN81 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
L1RE1Q9UN81 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
L1RE1Q9UN81 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
L1RE1Q9UN81 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
L1RE1Q9UN81 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
L1RE1Q9UN81 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
L1RE1Q9UN81 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
L1RE1Q9UN81 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
L1RE1Q9UN81 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms