Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS0

NFU1, NFU1 iron-sulfur cluster scaffold homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFU1Q9UMS0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFU1Q9UMS0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NFU1Q9UMS0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NFU1Q9UMS0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFU1Q9UMS0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFU1Q9UMS0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFU1Q9UMS0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFU1Q9UMS0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFU1Q9UMS0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFU1Q9UMS0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFU1Q9UMS0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFU1Q9UMS0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFU1Q9UMS0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFU1Q9UMS0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFU1Q9UMS0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFU1Q9UMS0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFU1Q9UMS0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFU1Q9UMS0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFU1Q9UMS0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFU1Q9UMS0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFU1Q9UMS0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFU1Q9UMS0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFU1Q9UMS0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFU1Q9UMS0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFU1Q9UMS0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFU1Q9UMS0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFU1Q9UMS0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
NFU1Q9UMS0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
NFU1Q9UMS0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFU1Q9UMS0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFU1Q9UMS0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFU1Q9UMS0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NFU1Q9UMS0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFU1Q9UMS0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFU1Q9UMS0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFU1Q9UMS0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFU1Q9UMS0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NFU1Q9UMS0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NFU1Q9UMS0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFU1Q9UMS0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFU1Q9UMS0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFU1Q9UMS0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFU1Q9UMS0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFU1Q9UMS0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFU1Q9UMS0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFU1Q9UMS0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFU1Q9UMS0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFU1Q9UMS0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFU1Q9UMS0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFU1Q9UMS0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFU1Q9UMS0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFU1Q9UMS0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFU1Q9UMS0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFU1Q9UMS0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFU1Q9UMS0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFU1Q9UMS0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFU1Q9UMS0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFU1Q9UMS0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NFU1Q9UMS0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NFU1Q9UMS0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NFU1Q9UMS0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NFU1Q9UMS0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFU1Q9UMS0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFU1Q9UMS0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFU1Q9UMS0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFU1Q9UMS0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFU1Q9UMS0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFU1Q9UMS0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFU1Q9UMS0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFU1Q9UMS0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFU1Q9UMS0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFU1Q9UMS0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFU1Q9UMS0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFU1Q9UMS0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFU1Q9UMS0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFU1Q9UMS0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NFU1Q9UMS0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NFU1Q9UMS0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFU1Q9UMS0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFU1Q9UMS0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFU1Q9UMS0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFU1Q9UMS0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFU1Q9UMS0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFU1Q9UMS0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFU1Q9UMS0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFU1Q9UMS0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFU1Q9UMS0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFU1Q9UMS0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFU1Q9UMS0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFU1Q9UMS0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFU1Q9UMS0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFU1Q9UMS0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFU1Q9UMS0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFU1Q9UMS0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFU1Q9UMS0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NFU1Q9UMS0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFU1Q9UMS0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFU1Q9UMS0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFU1Q9UMS0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFU1Q9UMS0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms