Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PALD1Q9ULE6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PALD1Q9ULE6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PALD1Q9ULE6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
PALD1Q9ULE6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
PALD1Q9ULE6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
PALD1Q9ULE6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PALD1Q9ULE6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PALD1Q9ULE6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PALD1Q9ULE6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PALD1Q9ULE6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PALD1Q9ULE6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PALD1Q9ULE6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PALD1Q9ULE6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PALD1Q9ULE6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
PALD1Q9ULE6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PALD1Q9ULE6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PALD1Q9ULE6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PALD1Q9ULE6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PALD1Q9ULE6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PALD1Q9ULE6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PALD1Q9ULE6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PALD1Q9ULE6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PALD1Q9ULE6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PALD1Q9ULE6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PALD1Q9ULE6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PALD1Q9ULE6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PALD1Q9ULE6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PALD1Q9ULE6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PALD1Q9ULE6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PALD1Q9ULE6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PALD1Q9ULE6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PALD1Q9ULE6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PALD1Q9ULE6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PALD1Q9ULE6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PALD1Q9ULE6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PALD1Q9ULE6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PALD1Q9ULE6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PALD1Q9ULE6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PALD1Q9ULE6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PALD1Q9ULE6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PALD1Q9ULE6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PALD1Q9ULE6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PALD1Q9ULE6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PALD1Q9ULE6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PALD1Q9ULE6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PALD1Q9ULE6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PALD1Q9ULE6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PALD1Q9ULE6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PALD1Q9ULE6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PALD1Q9ULE6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PALD1Q9ULE6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PALD1Q9ULE6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PALD1Q9ULE6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PALD1Q9ULE6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PALD1Q9ULE6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PALD1Q9ULE6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PALD1Q9ULE6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PALD1Q9ULE6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PALD1Q9ULE6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PALD1Q9ULE6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PALD1Q9ULE6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PALD1Q9ULE6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PALD1Q9ULE6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PALD1Q9ULE6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PALD1Q9ULE6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PALD1Q9ULE6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PALD1Q9ULE6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PALD1Q9ULE6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PALD1Q9ULE6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
PALD1Q9ULE6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
PALD1Q9ULE6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PALD1Q9ULE6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PALD1Q9ULE6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PALD1Q9ULE6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PALD1Q9ULE6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PALD1Q9ULE6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PALD1Q9ULE6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PALD1Q9ULE6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PALD1Q9ULE6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
PALD1Q9ULE6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PALD1Q9ULE6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PALD1Q9ULE6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PALD1Q9ULE6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PALD1Q9ULE6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PALD1Q9ULE6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PALD1Q9ULE6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PALD1Q9ULE6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
PALD1Q9ULE6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PALD1Q9ULE6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PALD1Q9ULE6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
PALD1Q9ULE6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PALD1Q9ULE6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PALD1Q9ULE6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PALD1Q9ULE6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PALD1Q9ULE6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PALD1Q9ULE6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PALD1Q9ULE6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PALD1Q9ULE6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PALD1Q9ULE6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms