Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CROTQ9UKG9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CROTQ9UKG9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CROTQ9UKG9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CROTQ9UKG9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CROTQ9UKG9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CROTQ9UKG9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CROTQ9UKG9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CROTQ9UKG9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CROTQ9UKG9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CROTQ9UKG9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CROTQ9UKG9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CROTQ9UKG9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CROTQ9UKG9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CROTQ9UKG9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CROTQ9UKG9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CROTQ9UKG9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CROTQ9UKG9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CROTQ9UKG9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CROTQ9UKG9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CROTQ9UKG9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CROTQ9UKG9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CROTQ9UKG9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CROTQ9UKG9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CROTQ9UKG9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CROTQ9UKG9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CROTQ9UKG9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CROTQ9UKG9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CROTQ9UKG9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CROTQ9UKG9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CROTQ9UKG9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CROTQ9UKG9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CROTQ9UKG9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CROTQ9UKG9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CROTQ9UKG9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CROTQ9UKG9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CROTQ9UKG9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CROTQ9UKG9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CROTQ9UKG9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CROTQ9UKG9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CROTQ9UKG9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CROTQ9UKG9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CROTQ9UKG9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CROTQ9UKG9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CROTQ9UKG9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CROTQ9UKG9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CROTQ9UKG9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CROTQ9UKG9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CROTQ9UKG9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CROTQ9UKG9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CROTQ9UKG9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CROTQ9UKG9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CROTQ9UKG9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CROTQ9UKG9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CROTQ9UKG9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CROTQ9UKG9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CROTQ9UKG9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CROTQ9UKG9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CROTQ9UKG9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CROTQ9UKG9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CROTQ9UKG9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CROTQ9UKG9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CROTQ9UKG9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CROTQ9UKG9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CROTQ9UKG9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CROTQ9UKG9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CROTQ9UKG9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CROTQ9UKG9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CROTQ9UKG9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CROTQ9UKG9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CROTQ9UKG9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CROTQ9UKG9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CROTQ9UKG9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CROTQ9UKG9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CROTQ9UKG9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CROTQ9UKG9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CROTQ9UKG9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CROTQ9UKG9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CROTQ9UKG9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CROTQ9UKG9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CROTQ9UKG9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CROTQ9UKG9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CROTQ9UKG9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CROTQ9UKG9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CROTQ9UKG9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CROTQ9UKG9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CROTQ9UKG9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CROTQ9UKG9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CROTQ9UKG9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CROTQ9UKG9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CROTQ9UKG9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CROTQ9UKG9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CROTQ9UKG9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CROTQ9UKG9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CROTQ9UKG9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CROTQ9UKG9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CROTQ9UKG9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CROTQ9UKG9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
CROTQ9UKG9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CROTQ9UKG9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms