Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SALL4Q9UJQ4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SALL4Q9UJQ4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SALL4Q9UJQ4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SALL4Q9UJQ4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SALL4Q9UJQ4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SALL4Q9UJQ4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SALL4Q9UJQ4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SALL4Q9UJQ4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SALL4Q9UJQ4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SALL4Q9UJQ4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SALL4Q9UJQ4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SALL4Q9UJQ4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SALL4Q9UJQ4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SALL4Q9UJQ4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SALL4Q9UJQ4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SALL4Q9UJQ4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SALL4Q9UJQ4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SALL4Q9UJQ4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SALL4Q9UJQ4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SALL4Q9UJQ4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SALL4Q9UJQ4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SALL4Q9UJQ4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SALL4Q9UJQ4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SALL4Q9UJQ4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SALL4Q9UJQ4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SALL4Q9UJQ4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SALL4Q9UJQ4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SALL4Q9UJQ4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SALL4Q9UJQ4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SALL4Q9UJQ4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SALL4Q9UJQ4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SALL4Q9UJQ4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SALL4Q9UJQ4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SALL4Q9UJQ4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SALL4Q9UJQ4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SALL4Q9UJQ4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SALL4Q9UJQ4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SALL4Q9UJQ4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SALL4Q9UJQ4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SALL4Q9UJQ4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SALL4Q9UJQ4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SALL4Q9UJQ4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SALL4Q9UJQ4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SALL4Q9UJQ4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SALL4Q9UJQ4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SALL4Q9UJQ4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SALL4Q9UJQ4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SALL4Q9UJQ4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SALL4Q9UJQ4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SALL4Q9UJQ4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SALL4Q9UJQ4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SALL4Q9UJQ4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SALL4Q9UJQ4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SALL4Q9UJQ4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SALL4Q9UJQ4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SALL4Q9UJQ4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SALL4Q9UJQ4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SALL4Q9UJQ4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SALL4Q9UJQ4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SALL4Q9UJQ4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SALL4Q9UJQ4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SALL4Q9UJQ4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SALL4Q9UJQ4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SALL4Q9UJQ4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SALL4Q9UJQ4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SALL4Q9UJQ4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SALL4Q9UJQ4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SALL4Q9UJQ4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SALL4Q9UJQ4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SALL4Q9UJQ4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SALL4Q9UJQ4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SALL4Q9UJQ4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SALL4Q9UJQ4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SALL4Q9UJQ4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SALL4Q9UJQ4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SALL4Q9UJQ4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SALL4Q9UJQ4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SALL4Q9UJQ4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SALL4Q9UJQ4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SALL4Q9UJQ4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SALL4Q9UJQ4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SALL4Q9UJQ4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SALL4Q9UJQ4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SALL4Q9UJQ4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SALL4Q9UJQ4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SALL4Q9UJQ4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SALL4Q9UJQ4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SALL4Q9UJQ4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SALL4Q9UJQ4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SALL4Q9UJQ4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SALL4Q9UJQ4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SALL4Q9UJQ4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SALL4Q9UJQ4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SALL4Q9UJQ4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SALL4Q9UJQ4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SALL4Q9UJQ4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SALL4Q9UJQ4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SALL4Q9UJQ4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SALL4Q9UJQ4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.7 ms