Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJA2

CRLS1, Cardiolipin synthase (CMP-forming), humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRLS1Q9UJA2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRLS1Q9UJA2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRLS1Q9UJA2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRLS1Q9UJA2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CRLS1Q9UJA2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CRLS1Q9UJA2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CRLS1Q9UJA2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CRLS1Q9UJA2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CRLS1Q9UJA2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRLS1Q9UJA2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CRLS1Q9UJA2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRLS1Q9UJA2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRLS1Q9UJA2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRLS1Q9UJA2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRLS1Q9UJA2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRLS1Q9UJA2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CRLS1Q9UJA2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRLS1Q9UJA2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRLS1Q9UJA2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRLS1Q9UJA2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CRLS1Q9UJA2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRLS1Q9UJA2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRLS1Q9UJA2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRLS1Q9UJA2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRLS1Q9UJA2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRLS1Q9UJA2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRLS1Q9UJA2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRLS1Q9UJA2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRLS1Q9UJA2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRLS1Q9UJA2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRLS1Q9UJA2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRLS1Q9UJA2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRLS1Q9UJA2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRLS1Q9UJA2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRLS1Q9UJA2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRLS1Q9UJA2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRLS1Q9UJA2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CRLS1Q9UJA2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRLS1Q9UJA2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRLS1Q9UJA2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRLS1Q9UJA2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRLS1Q9UJA2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRLS1Q9UJA2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRLS1Q9UJA2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRLS1Q9UJA2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRLS1Q9UJA2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRLS1Q9UJA2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRLS1Q9UJA2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRLS1Q9UJA2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRLS1Q9UJA2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRLS1Q9UJA2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRLS1Q9UJA2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRLS1Q9UJA2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRLS1Q9UJA2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRLS1Q9UJA2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRLS1Q9UJA2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRLS1Q9UJA2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRLS1Q9UJA2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRLS1Q9UJA2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRLS1Q9UJA2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRLS1Q9UJA2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRLS1Q9UJA2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRLS1Q9UJA2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRLS1Q9UJA2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRLS1Q9UJA2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRLS1Q9UJA2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRLS1Q9UJA2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRLS1Q9UJA2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRLS1Q9UJA2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRLS1Q9UJA2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRLS1Q9UJA2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRLS1Q9UJA2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CRLS1Q9UJA2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRLS1Q9UJA2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRLS1Q9UJA2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRLS1Q9UJA2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRLS1Q9UJA2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CRLS1Q9UJA2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRLS1Q9UJA2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRLS1Q9UJA2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRLS1Q9UJA2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CRLS1Q9UJA2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CRLS1Q9UJA2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRLS1Q9UJA2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRLS1Q9UJA2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRLS1Q9UJA2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRLS1Q9UJA2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRLS1Q9UJA2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRLS1Q9UJA2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRLS1Q9UJA2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRLS1Q9UJA2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRLS1Q9UJA2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRLS1Q9UJA2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRLS1Q9UJA2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRLS1Q9UJA2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CRLS1Q9UJA2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRLS1Q9UJA2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRLS1Q9UJA2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRLS1Q9UJA2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRLS1Q9UJA2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms