Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA4

LAMTOR3, Ragulator complex protein LAMTOR3, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR3Q9UHA4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMTOR3Q9UHA4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMTOR3Q9UHA4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMTOR3Q9UHA4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMTOR3Q9UHA4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMTOR3Q9UHA4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMTOR3Q9UHA4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMTOR3Q9UHA4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMTOR3Q9UHA4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMTOR3Q9UHA4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMTOR3Q9UHA4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMTOR3Q9UHA4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMTOR3Q9UHA4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMTOR3Q9UHA4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMTOR3Q9UHA4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMTOR3Q9UHA4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMTOR3Q9UHA4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMTOR3Q9UHA4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMTOR3Q9UHA4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMTOR3Q9UHA4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMTOR3Q9UHA4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMTOR3Q9UHA4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMTOR3Q9UHA4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMTOR3Q9UHA4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMTOR3Q9UHA4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMTOR3Q9UHA4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMTOR3Q9UHA4 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAMTOR3Q9UHA4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAMTOR3Q9UHA4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAMTOR3Q9UHA4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAMTOR3Q9UHA4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAMTOR3Q9UHA4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAMTOR3Q9UHA4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAMTOR3Q9UHA4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAMTOR3Q9UHA4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LAMTOR3Q9UHA4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LAMTOR3Q9UHA4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMTOR3Q9UHA4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMTOR3Q9UHA4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMTOR3Q9UHA4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMTOR3Q9UHA4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMTOR3Q9UHA4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMTOR3Q9UHA4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMTOR3Q9UHA4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LAMTOR3Q9UHA4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMTOR3Q9UHA4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMTOR3Q9UHA4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMTOR3Q9UHA4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMTOR3Q9UHA4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMTOR3Q9UHA4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMTOR3Q9UHA4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMTOR3Q9UHA4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LAMTOR3Q9UHA4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMTOR3Q9UHA4 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMTOR3Q9UHA4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMTOR3Q9UHA4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMTOR3Q9UHA4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMTOR3Q9UHA4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMTOR3Q9UHA4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LAMTOR3Q9UHA4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMTOR3Q9UHA4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMTOR3Q9UHA4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMTOR3Q9UHA4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMTOR3Q9UHA4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMTOR3Q9UHA4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMTOR3Q9UHA4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMTOR3Q9UHA4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMTOR3Q9UHA4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMTOR3Q9UHA4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMTOR3Q9UHA4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMTOR3Q9UHA4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMTOR3Q9UHA4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LAMTOR3Q9UHA4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMTOR3Q9UHA4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMTOR3Q9UHA4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMTOR3Q9UHA4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LAMTOR3Q9UHA4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMTOR3Q9UHA4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMTOR3Q9UHA4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMTOR3Q9UHA4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMTOR3Q9UHA4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMTOR3Q9UHA4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMTOR3Q9UHA4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMTOR3Q9UHA4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMTOR3Q9UHA4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMTOR3Q9UHA4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMTOR3Q9UHA4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMTOR3Q9UHA4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LAMTOR3Q9UHA4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMTOR3Q9UHA4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMTOR3Q9UHA4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMTOR3Q9UHA4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMTOR3Q9UHA4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMTOR3Q9UHA4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMTOR3Q9UHA4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMTOR3Q9UHA4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMTOR3Q9UHA4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMTOR3Q9UHA4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMTOR3Q9UHA4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMTOR3Q9UHA4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms