Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS3

DNAJB9, DnaJ homolog subfamily B member 9, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB9Q9UBS3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAJB9Q9UBS3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DNAJB9Q9UBS3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAJB9Q9UBS3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAJB9Q9UBS3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAJB9Q9UBS3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DNAJB9Q9UBS3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAJB9Q9UBS3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAJB9Q9UBS3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAJB9Q9UBS3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAJB9Q9UBS3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DNAJB9Q9UBS3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAJB9Q9UBS3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAJB9Q9UBS3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAJB9Q9UBS3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAJB9Q9UBS3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAJB9Q9UBS3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DNAJB9Q9UBS3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJB9Q9UBS3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJB9Q9UBS3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJB9Q9UBS3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJB9Q9UBS3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DNAJB9Q9UBS3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJB9Q9UBS3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJB9Q9UBS3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJB9Q9UBS3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJB9Q9UBS3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJB9Q9UBS3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJB9Q9UBS3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJB9Q9UBS3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJB9Q9UBS3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DNAJB9Q9UBS3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAJB9Q9UBS3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAJB9Q9UBS3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DNAJB9Q9UBS3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJB9Q9UBS3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJB9Q9UBS3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJB9Q9UBS3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJB9Q9UBS3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJB9Q9UBS3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJB9Q9UBS3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJB9Q9UBS3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJB9Q9UBS3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJB9Q9UBS3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJB9Q9UBS3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJB9Q9UBS3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJB9Q9UBS3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJB9Q9UBS3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJB9Q9UBS3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJB9Q9UBS3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJB9Q9UBS3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJB9Q9UBS3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJB9Q9UBS3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJB9Q9UBS3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJB9Q9UBS3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJB9Q9UBS3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJB9Q9UBS3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJB9Q9UBS3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAJB9Q9UBS3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAJB9Q9UBS3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAJB9Q9UBS3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAJB9Q9UBS3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAJB9Q9UBS3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAJB9Q9UBS3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAJB9Q9UBS3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJB9Q9UBS3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJB9Q9UBS3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJB9Q9UBS3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJB9Q9UBS3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJB9Q9UBS3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJB9Q9UBS3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJB9Q9UBS3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DNAJB9Q9UBS3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DNAJB9Q9UBS3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DNAJB9Q9UBS3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNAJB9Q9UBS3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DNAJB9Q9UBS3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAJB9Q9UBS3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAJB9Q9UBS3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAJB9Q9UBS3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAJB9Q9UBS3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAJB9Q9UBS3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAJB9Q9UBS3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAJB9Q9UBS3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAJB9Q9UBS3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAJB9Q9UBS3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAJB9Q9UBS3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAJB9Q9UBS3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAJB9Q9UBS3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAJB9Q9UBS3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAJB9Q9UBS3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAJB9Q9UBS3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAJB9Q9UBS3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAJB9Q9UBS3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAJB9Q9UBS3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAJB9Q9UBS3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAJB9Q9UBS3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAJB9Q9UBS3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAJB9Q9UBS3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAJB9Q9UBS3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms