Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBJ2

ABCD2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD2Q9UBJ2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCD2Q9UBJ2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCD2Q9UBJ2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCD2Q9UBJ2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCD2Q9UBJ2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCD2Q9UBJ2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCD2Q9UBJ2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCD2Q9UBJ2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCD2Q9UBJ2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCD2Q9UBJ2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCD2Q9UBJ2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCD2Q9UBJ2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCD2Q9UBJ2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCD2Q9UBJ2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ABCD2Q9UBJ2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCD2Q9UBJ2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCD2Q9UBJ2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCD2Q9UBJ2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCD2Q9UBJ2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCD2Q9UBJ2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCD2Q9UBJ2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCD2Q9UBJ2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCD2Q9UBJ2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCD2Q9UBJ2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCD2Q9UBJ2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCD2Q9UBJ2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCD2Q9UBJ2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCD2Q9UBJ2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCD2Q9UBJ2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCD2Q9UBJ2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCD2Q9UBJ2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCD2Q9UBJ2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCD2Q9UBJ2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCD2Q9UBJ2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCD2Q9UBJ2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ABCD2Q9UBJ2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCD2Q9UBJ2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCD2Q9UBJ2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCD2Q9UBJ2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCD2Q9UBJ2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCD2Q9UBJ2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCD2Q9UBJ2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCD2Q9UBJ2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCD2Q9UBJ2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ABCD2Q9UBJ2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCD2Q9UBJ2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCD2Q9UBJ2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCD2Q9UBJ2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCD2Q9UBJ2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCD2Q9UBJ2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCD2Q9UBJ2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCD2Q9UBJ2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCD2Q9UBJ2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCD2Q9UBJ2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCD2Q9UBJ2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCD2Q9UBJ2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCD2Q9UBJ2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCD2Q9UBJ2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCD2Q9UBJ2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCD2Q9UBJ2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCD2Q9UBJ2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCD2Q9UBJ2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCD2Q9UBJ2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCD2Q9UBJ2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCD2Q9UBJ2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCD2Q9UBJ2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCD2Q9UBJ2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCD2Q9UBJ2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCD2Q9UBJ2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCD2Q9UBJ2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCD2Q9UBJ2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCD2Q9UBJ2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCD2Q9UBJ2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCD2Q9UBJ2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCD2Q9UBJ2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCD2Q9UBJ2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCD2Q9UBJ2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCD2Q9UBJ2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCD2Q9UBJ2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCD2Q9UBJ2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCD2Q9UBJ2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCD2Q9UBJ2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCD2Q9UBJ2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCD2Q9UBJ2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCD2Q9UBJ2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCD2Q9UBJ2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCD2Q9UBJ2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCD2Q9UBJ2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABCD2Q9UBJ2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCD2Q9UBJ2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCD2Q9UBJ2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCD2Q9UBJ2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCD2Q9UBJ2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABCD2Q9UBJ2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCD2Q9UBJ2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCD2Q9UBJ2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCD2Q9UBJ2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCD2Q9UBJ2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCD2Q9UBJ2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABCD2Q9UBJ2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms