Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC9

SPRR3, Small proline-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR3Q9UBC9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPRR3Q9UBC9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPRR3Q9UBC9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPRR3Q9UBC9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPRR3Q9UBC9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPRR3Q9UBC9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPRR3Q9UBC9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SPRR3Q9UBC9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPRR3Q9UBC9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPRR3Q9UBC9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPRR3Q9UBC9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPRR3Q9UBC9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPRR3Q9UBC9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPRR3Q9UBC9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPRR3Q9UBC9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPRR3Q9UBC9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPRR3Q9UBC9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPRR3Q9UBC9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPRR3Q9UBC9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SPRR3Q9UBC9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPRR3Q9UBC9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPRR3Q9UBC9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPRR3Q9UBC9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPRR3Q9UBC9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPRR3Q9UBC9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SPRR3Q9UBC9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPRR3Q9UBC9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPRR3Q9UBC9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPRR3Q9UBC9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPRR3Q9UBC9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPRR3Q9UBC9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPRR3Q9UBC9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPRR3Q9UBC9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPRR3Q9UBC9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPRR3Q9UBC9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPRR3Q9UBC9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPRR3Q9UBC9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPRR3Q9UBC9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPRR3Q9UBC9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPRR3Q9UBC9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPRR3Q9UBC9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPRR3Q9UBC9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPRR3Q9UBC9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SPRR3Q9UBC9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPRR3Q9UBC9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPRR3Q9UBC9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPRR3Q9UBC9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPRR3Q9UBC9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPRR3Q9UBC9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPRR3Q9UBC9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SPRR3Q9UBC9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPRR3Q9UBC9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPRR3Q9UBC9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPRR3Q9UBC9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPRR3Q9UBC9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPRR3Q9UBC9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPRR3Q9UBC9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPRR3Q9UBC9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPRR3Q9UBC9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPRR3Q9UBC9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPRR3Q9UBC9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPRR3Q9UBC9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPRR3Q9UBC9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPRR3Q9UBC9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPRR3Q9UBC9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SPRR3Q9UBC9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPRR3Q9UBC9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SPRR3Q9UBC9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPRR3Q9UBC9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPRR3Q9UBC9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPRR3Q9UBC9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPRR3Q9UBC9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SPRR3Q9UBC9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPRR3Q9UBC9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPRR3Q9UBC9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPRR3Q9UBC9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPRR3Q9UBC9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPRR3Q9UBC9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRR3Q9UBC9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRR3Q9UBC9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRR3Q9UBC9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRR3Q9UBC9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRR3Q9UBC9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRR3Q9UBC9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRR3Q9UBC9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRR3Q9UBC9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRR3Q9UBC9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPRR3Q9UBC9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPRR3Q9UBC9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPRR3Q9UBC9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPRR3Q9UBC9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPRR3Q9UBC9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPRR3Q9UBC9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SPRR3Q9UBC9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRR3Q9UBC9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRR3Q9UBC9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRR3Q9UBC9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRR3Q9UBC9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRR3Q9UBC9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPRR3Q9UBC9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms