Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL13Q9P2N7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL13Q9P2N7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL13Q9P2N7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL13Q9P2N7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL13Q9P2N7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL13Q9P2N7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL13Q9P2N7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL13Q9P2N7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL13Q9P2N7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL13Q9P2N7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL13Q9P2N7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL13Q9P2N7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL13Q9P2N7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL13Q9P2N7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL13Q9P2N7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KLHL13Q9P2N7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL13Q9P2N7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL13Q9P2N7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL13Q9P2N7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL13Q9P2N7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL13Q9P2N7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL13Q9P2N7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL13Q9P2N7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL13Q9P2N7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL13Q9P2N7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL13Q9P2N7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL13Q9P2N7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL13Q9P2N7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL13Q9P2N7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL13Q9P2N7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL13Q9P2N7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL13Q9P2N7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL13Q9P2N7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL13Q9P2N7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL13Q9P2N7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL13Q9P2N7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL13Q9P2N7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL13Q9P2N7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL13Q9P2N7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL13Q9P2N7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL13Q9P2N7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL13Q9P2N7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL13Q9P2N7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL13Q9P2N7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL13Q9P2N7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL13Q9P2N7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLHL13Q9P2N7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
KLHL13Q9P2N7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL13Q9P2N7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL13Q9P2N7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL13Q9P2N7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL13Q9P2N7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL13Q9P2N7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL13Q9P2N7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL13Q9P2N7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL13Q9P2N7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL13Q9P2N7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL13Q9P2N7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL13Q9P2N7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL13Q9P2N7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL13Q9P2N7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL13Q9P2N7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL13Q9P2N7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL13Q9P2N7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL13Q9P2N7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL13Q9P2N7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL13Q9P2N7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL13Q9P2N7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL13Q9P2N7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL13Q9P2N7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL13Q9P2N7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL13Q9P2N7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL13Q9P2N7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL13Q9P2N7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL13Q9P2N7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL13Q9P2N7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL13Q9P2N7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL13Q9P2N7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL13Q9P2N7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL13Q9P2N7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL13Q9P2N7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL13Q9P2N7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL13Q9P2N7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL13Q9P2N7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL13Q9P2N7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL13Q9P2N7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL13Q9P2N7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHL13Q9P2N7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL13Q9P2N7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL13Q9P2N7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL13Q9P2N7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL13Q9P2N7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL13Q9P2N7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL13Q9P2N7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL13Q9P2N7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL13Q9P2N7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL13Q9P2N7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL13Q9P2N7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL13Q9P2N7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms