Protein–RNA interactions for Protein: Q9P244

LRFN1, Leucine-rich repeat and fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN1Q9P244 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRFN1Q9P244 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRFN1Q9P244 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRFN1Q9P244 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRFN1Q9P244 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRFN1Q9P244 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRFN1Q9P244 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRFN1Q9P244 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRFN1Q9P244 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRFN1Q9P244 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRFN1Q9P244 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRFN1Q9P244 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRFN1Q9P244 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LRFN1Q9P244 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRFN1Q9P244 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRFN1Q9P244 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRFN1Q9P244 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRFN1Q9P244 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRFN1Q9P244 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRFN1Q9P244 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRFN1Q9P244 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRFN1Q9P244 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRFN1Q9P244 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRFN1Q9P244 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRFN1Q9P244 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRFN1Q9P244 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRFN1Q9P244 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRFN1Q9P244 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRFN1Q9P244 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRFN1Q9P244 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRFN1Q9P244 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRFN1Q9P244 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRFN1Q9P244 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LRFN1Q9P244 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRFN1Q9P244 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRFN1Q9P244 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRFN1Q9P244 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRFN1Q9P244 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRFN1Q9P244 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRFN1Q9P244 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRFN1Q9P244 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LRFN1Q9P244 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LRFN1Q9P244 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRFN1Q9P244 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRFN1Q9P244 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRFN1Q9P244 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRFN1Q9P244 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRFN1Q9P244 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRFN1Q9P244 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRFN1Q9P244 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRFN1Q9P244 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LRFN1Q9P244 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRFN1Q9P244 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRFN1Q9P244 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRFN1Q9P244 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRFN1Q9P244 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRFN1Q9P244 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRFN1Q9P244 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LRFN1Q9P244 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRFN1Q9P244 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRFN1Q9P244 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRFN1Q9P244 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRFN1Q9P244 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRFN1Q9P244 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRFN1Q9P244 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRFN1Q9P244 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRFN1Q9P244 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRFN1Q9P244 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRFN1Q9P244 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRFN1Q9P244 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRFN1Q9P244 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LRFN1Q9P244 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRFN1Q9P244 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRFN1Q9P244 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRFN1Q9P244 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRFN1Q9P244 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRFN1Q9P244 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRFN1Q9P244 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRFN1Q9P244 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRFN1Q9P244 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRFN1Q9P244 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRFN1Q9P244 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRFN1Q9P244 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRFN1Q9P244 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRFN1Q9P244 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRFN1Q9P244 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRFN1Q9P244 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRFN1Q9P244 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRFN1Q9P244 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRFN1Q9P244 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRFN1Q9P244 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRFN1Q9P244 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRFN1Q9P244 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRFN1Q9P244 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRFN1Q9P244 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRFN1Q9P244 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRFN1Q9P244 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRFN1Q9P244 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRFN1Q9P244 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRFN1Q9P244 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms