Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KCMF1Q9P0J7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCMF1Q9P0J7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCMF1Q9P0J7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KCMF1Q9P0J7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCMF1Q9P0J7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCMF1Q9P0J7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KCMF1Q9P0J7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCMF1Q9P0J7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KCMF1Q9P0J7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KCMF1Q9P0J7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCMF1Q9P0J7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCMF1Q9P0J7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCMF1Q9P0J7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCMF1Q9P0J7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCMF1Q9P0J7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCMF1Q9P0J7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCMF1Q9P0J7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCMF1Q9P0J7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCMF1Q9P0J7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCMF1Q9P0J7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KCMF1Q9P0J7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCMF1Q9P0J7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCMF1Q9P0J7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCMF1Q9P0J7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCMF1Q9P0J7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCMF1Q9P0J7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KCMF1Q9P0J7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCMF1Q9P0J7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCMF1Q9P0J7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCMF1Q9P0J7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCMF1Q9P0J7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCMF1Q9P0J7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KCMF1Q9P0J7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KCMF1Q9P0J7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KCMF1Q9P0J7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KCMF1Q9P0J7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCMF1Q9P0J7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCMF1Q9P0J7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCMF1Q9P0J7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCMF1Q9P0J7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCMF1Q9P0J7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCMF1Q9P0J7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCMF1Q9P0J7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCMF1Q9P0J7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCMF1Q9P0J7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCMF1Q9P0J7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCMF1Q9P0J7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCMF1Q9P0J7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCMF1Q9P0J7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCMF1Q9P0J7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCMF1Q9P0J7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCMF1Q9P0J7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCMF1Q9P0J7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCMF1Q9P0J7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCMF1Q9P0J7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCMF1Q9P0J7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCMF1Q9P0J7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCMF1Q9P0J7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCMF1Q9P0J7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCMF1Q9P0J7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCMF1Q9P0J7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCMF1Q9P0J7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCMF1Q9P0J7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCMF1Q9P0J7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCMF1Q9P0J7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCMF1Q9P0J7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCMF1Q9P0J7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCMF1Q9P0J7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCMF1Q9P0J7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCMF1Q9P0J7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCMF1Q9P0J7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCMF1Q9P0J7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
KCMF1Q9P0J7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCMF1Q9P0J7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCMF1Q9P0J7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCMF1Q9P0J7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCMF1Q9P0J7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCMF1Q9P0J7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCMF1Q9P0J7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCMF1Q9P0J7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCMF1Q9P0J7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KCMF1Q9P0J7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCMF1Q9P0J7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCMF1Q9P0J7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCMF1Q9P0J7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCMF1Q9P0J7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCMF1Q9P0J7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCMF1Q9P0J7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCMF1Q9P0J7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KCMF1Q9P0J7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCMF1Q9P0J7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCMF1Q9P0J7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCMF1Q9P0J7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCMF1Q9P0J7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KCMF1Q9P0J7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCMF1Q9P0J7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCMF1Q9P0J7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCMF1Q9P0J7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCMF1Q9P0J7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms