Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
HOXC10Q9NYD6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
HOXC10Q9NYD6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
HOXC10Q9NYD6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HOXC10Q9NYD6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HOXC10Q9NYD6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HOXC10Q9NYD6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HOXC10Q9NYD6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HOXC10Q9NYD6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
HOXC10Q9NYD6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HOXC10Q9NYD6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HOXC10Q9NYD6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HOXC10Q9NYD6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
HOXC10Q9NYD6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HOXC10Q9NYD6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HOXC10Q9NYD6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HOXC10Q9NYD6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HOXC10Q9NYD6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HOXC10Q9NYD6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HOXC10Q9NYD6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HOXC10Q9NYD6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
HOXC10Q9NYD6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
HOXC10Q9NYD6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HOXC10Q9NYD6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HOXC10Q9NYD6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HOXC10Q9NYD6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HOXC10Q9NYD6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HOXC10Q9NYD6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HOXC10Q9NYD6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HOXC10Q9NYD6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HOXC10Q9NYD6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HOXC10Q9NYD6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HOXC10Q9NYD6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
HOXC10Q9NYD6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HOXC10Q9NYD6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HOXC10Q9NYD6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HOXC10Q9NYD6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HOXC10Q9NYD6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HOXC10Q9NYD6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HOXC10Q9NYD6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HOXC10Q9NYD6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HOXC10Q9NYD6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HOXC10Q9NYD6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HOXC10Q9NYD6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
HOXC10Q9NYD6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HOXC10Q9NYD6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HOXC10Q9NYD6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HOXC10Q9NYD6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
HOXC10Q9NYD6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HOXC10Q9NYD6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HOXC10Q9NYD6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HOXC10Q9NYD6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HOXC10Q9NYD6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HOXC10Q9NYD6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HOXC10Q9NYD6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HOXC10Q9NYD6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HOXC10Q9NYD6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HOXC10Q9NYD6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HOXC10Q9NYD6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HOXC10Q9NYD6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HOXC10Q9NYD6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HOXC10Q9NYD6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HOXC10Q9NYD6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HOXC10Q9NYD6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HOXC10Q9NYD6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HOXC10Q9NYD6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HOXC10Q9NYD6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HOXC10Q9NYD6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
HOXC10Q9NYD6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HOXC10Q9NYD6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HOXC10Q9NYD6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HOXC10Q9NYD6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HOXC10Q9NYD6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HOXC10Q9NYD6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HOXC10Q9NYD6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
HOXC10Q9NYD6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HOXC10Q9NYD6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HOXC10Q9NYD6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HOXC10Q9NYD6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HOXC10Q9NYD6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HOXC10Q9NYD6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HOXC10Q9NYD6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HOXC10Q9NYD6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HOXC10Q9NYD6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HOXC10Q9NYD6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HOXC10Q9NYD6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HOXC10Q9NYD6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HOXC10Q9NYD6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
HOXC10Q9NYD6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
HOXC10Q9NYD6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
HOXC10Q9NYD6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HOXC10Q9NYD6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HOXC10Q9NYD6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HOXC10Q9NYD6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HOXC10Q9NYD6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HOXC10Q9NYD6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HOXC10Q9NYD6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HOXC10Q9NYD6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HOXC10Q9NYD6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HOXC10Q9NYD6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
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