Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY59

SMPD3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD3Q9NY59 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMPD3Q9NY59 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMPD3Q9NY59 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMPD3Q9NY59 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMPD3Q9NY59 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMPD3Q9NY59 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMPD3Q9NY59 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMPD3Q9NY59 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMPD3Q9NY59 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMPD3Q9NY59 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMPD3Q9NY59 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMPD3Q9NY59 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMPD3Q9NY59 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMPD3Q9NY59 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMPD3Q9NY59 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMPD3Q9NY59 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMPD3Q9NY59 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMPD3Q9NY59 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMPD3Q9NY59 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMPD3Q9NY59 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMPD3Q9NY59 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMPD3Q9NY59 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMPD3Q9NY59 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMPD3Q9NY59 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMPD3Q9NY59 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMPD3Q9NY59 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMPD3Q9NY59 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMPD3Q9NY59 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMPD3Q9NY59 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMPD3Q9NY59 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMPD3Q9NY59 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMPD3Q9NY59 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SMPD3Q9NY59 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMPD3Q9NY59 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMPD3Q9NY59 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMPD3Q9NY59 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMPD3Q9NY59 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMPD3Q9NY59 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMPD3Q9NY59 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMPD3Q9NY59 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMPD3Q9NY59 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMPD3Q9NY59 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMPD3Q9NY59 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMPD3Q9NY59 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMPD3Q9NY59 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SMPD3Q9NY59 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMPD3Q9NY59 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMPD3Q9NY59 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMPD3Q9NY59 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMPD3Q9NY59 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMPD3Q9NY59 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SMPD3Q9NY59 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMPD3Q9NY59 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMPD3Q9NY59 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMPD3Q9NY59 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMPD3Q9NY59 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMPD3Q9NY59 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMPD3Q9NY59 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMPD3Q9NY59 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMPD3Q9NY59 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMPD3Q9NY59 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMPD3Q9NY59 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMPD3Q9NY59 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMPD3Q9NY59 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMPD3Q9NY59 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMPD3Q9NY59 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMPD3Q9NY59 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMPD3Q9NY59 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMPD3Q9NY59 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMPD3Q9NY59 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMPD3Q9NY59 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMPD3Q9NY59 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMPD3Q9NY59 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMPD3Q9NY59 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMPD3Q9NY59 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMPD3Q9NY59 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMPD3Q9NY59 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMPD3Q9NY59 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMPD3Q9NY59 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMPD3Q9NY59 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMPD3Q9NY59 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMPD3Q9NY59 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMPD3Q9NY59 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMPD3Q9NY59 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMPD3Q9NY59 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMPD3Q9NY59 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMPD3Q9NY59 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMPD3Q9NY59 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMPD3Q9NY59 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMPD3Q9NY59 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMPD3Q9NY59 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMPD3Q9NY59 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMPD3Q9NY59 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMPD3Q9NY59 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMPD3Q9NY59 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMPD3Q9NY59 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMPD3Q9NY59 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMPD3Q9NY59 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMPD3Q9NY59 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMPD3Q9NY59 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms