Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A12Q9NXJ0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A12Q9NXJ0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A12Q9NXJ0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MS4A12Q9NXJ0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MS4A12Q9NXJ0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MS4A12Q9NXJ0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MS4A12Q9NXJ0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MS4A12Q9NXJ0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MS4A12Q9NXJ0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MS4A12Q9NXJ0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MS4A12Q9NXJ0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MS4A12Q9NXJ0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MS4A12Q9NXJ0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MS4A12Q9NXJ0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MS4A12Q9NXJ0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MS4A12Q9NXJ0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MS4A12Q9NXJ0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MS4A12Q9NXJ0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MS4A12Q9NXJ0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MS4A12Q9NXJ0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MS4A12Q9NXJ0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MS4A12Q9NXJ0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MS4A12Q9NXJ0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MS4A12Q9NXJ0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MS4A12Q9NXJ0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MS4A12Q9NXJ0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MS4A12Q9NXJ0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MS4A12Q9NXJ0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MS4A12Q9NXJ0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MS4A12Q9NXJ0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MS4A12Q9NXJ0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MS4A12Q9NXJ0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MS4A12Q9NXJ0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MS4A12Q9NXJ0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MS4A12Q9NXJ0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MS4A12Q9NXJ0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MS4A12Q9NXJ0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MS4A12Q9NXJ0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MS4A12Q9NXJ0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MS4A12Q9NXJ0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MS4A12Q9NXJ0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MS4A12Q9NXJ0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MS4A12Q9NXJ0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MS4A12Q9NXJ0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MS4A12Q9NXJ0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MS4A12Q9NXJ0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MS4A12Q9NXJ0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MS4A12Q9NXJ0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MS4A12Q9NXJ0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MS4A12Q9NXJ0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MS4A12Q9NXJ0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MS4A12Q9NXJ0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MS4A12Q9NXJ0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MS4A12Q9NXJ0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MS4A12Q9NXJ0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MS4A12Q9NXJ0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MS4A12Q9NXJ0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MS4A12Q9NXJ0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MS4A12Q9NXJ0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MS4A12Q9NXJ0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MS4A12Q9NXJ0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MS4A12Q9NXJ0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MS4A12Q9NXJ0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MS4A12Q9NXJ0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MS4A12Q9NXJ0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MS4A12Q9NXJ0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MS4A12Q9NXJ0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MS4A12Q9NXJ0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MS4A12Q9NXJ0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MS4A12Q9NXJ0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A12Q9NXJ0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A12Q9NXJ0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A12Q9NXJ0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A12Q9NXJ0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A12Q9NXJ0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A12Q9NXJ0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A12Q9NXJ0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A12Q9NXJ0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A12Q9NXJ0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A12Q9NXJ0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A12Q9NXJ0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A12Q9NXJ0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A12Q9NXJ0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A12Q9NXJ0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A12Q9NXJ0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A12Q9NXJ0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A12Q9NXJ0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A12Q9NXJ0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A12Q9NXJ0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A12Q9NXJ0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A12Q9NXJ0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A12Q9NXJ0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A12Q9NXJ0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A12Q9NXJ0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A12Q9NXJ0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A12Q9NXJ0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A12Q9NXJ0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A12Q9NXJ0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A12Q9NXJ0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms