Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWU1

OXSM, 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXSMQ9NWU1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
OXSMQ9NWU1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
OXSMQ9NWU1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OXSMQ9NWU1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
OXSMQ9NWU1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OXSMQ9NWU1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
OXSMQ9NWU1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OXSMQ9NWU1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
OXSMQ9NWU1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
OXSMQ9NWU1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
OXSMQ9NWU1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
OXSMQ9NWU1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
OXSMQ9NWU1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
OXSMQ9NWU1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
OXSMQ9NWU1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
OXSMQ9NWU1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
OXSMQ9NWU1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
OXSMQ9NWU1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OXSMQ9NWU1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
OXSMQ9NWU1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
OXSMQ9NWU1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
OXSMQ9NWU1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OXSMQ9NWU1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
OXSMQ9NWU1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
OXSMQ9NWU1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
OXSMQ9NWU1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
OXSMQ9NWU1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
OXSMQ9NWU1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
OXSMQ9NWU1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
OXSMQ9NWU1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OXSMQ9NWU1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OXSMQ9NWU1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
OXSMQ9NWU1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
OXSMQ9NWU1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
OXSMQ9NWU1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
OXSMQ9NWU1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
OXSMQ9NWU1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
OXSMQ9NWU1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
OXSMQ9NWU1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
OXSMQ9NWU1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
OXSMQ9NWU1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
OXSMQ9NWU1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
OXSMQ9NWU1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
OXSMQ9NWU1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
OXSMQ9NWU1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
OXSMQ9NWU1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
OXSMQ9NWU1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OXSMQ9NWU1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
OXSMQ9NWU1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OXSMQ9NWU1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
OXSMQ9NWU1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
OXSMQ9NWU1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
OXSMQ9NWU1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
OXSMQ9NWU1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
OXSMQ9NWU1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
OXSMQ9NWU1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
OXSMQ9NWU1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OXSMQ9NWU1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OXSMQ9NWU1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OXSMQ9NWU1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OXSMQ9NWU1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OXSMQ9NWU1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
OXSMQ9NWU1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OXSMQ9NWU1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OXSMQ9NWU1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OXSMQ9NWU1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OXSMQ9NWU1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
OXSMQ9NWU1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
OXSMQ9NWU1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
OXSMQ9NWU1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
OXSMQ9NWU1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
OXSMQ9NWU1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
OXSMQ9NWU1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OXSMQ9NWU1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
OXSMQ9NWU1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OXSMQ9NWU1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
OXSMQ9NWU1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OXSMQ9NWU1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OXSMQ9NWU1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OXSMQ9NWU1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OXSMQ9NWU1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OXSMQ9NWU1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OXSMQ9NWU1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
OXSMQ9NWU1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OXSMQ9NWU1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
OXSMQ9NWU1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
OXSMQ9NWU1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OXSMQ9NWU1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OXSMQ9NWU1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
OXSMQ9NWU1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OXSMQ9NWU1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
OXSMQ9NWU1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OXSMQ9NWU1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
OXSMQ9NWU1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
OXSMQ9NWU1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
OXSMQ9NWU1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OXSMQ9NWU1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OXSMQ9NWU1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
OXSMQ9NWU1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OXSMQ9NWU1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms