Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 PPFIBP2-217ENST00000530189 320 ntTSL 24.87□□□□□ -1.632e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 DMTF1-228ENST00000579850 3483 ntTSL 54.79□□□□□ -1.642e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 RBMS1-209ENST00000474820 4016 ntTSL 1 (best)4.79□□□□□ -1.642e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 DMTF1-208ENST00000425406 3868 ntTSL 24.65□□□□□ -1.662e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 INTS10-219ENST00000607660 492 nt4.65□□□□□ -1.672e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.72e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.72e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 DMTF1-224ENST00000547146 3657 ntTSL 54.35□□□□□ -1.712e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 EIF5-219ENST00000561380 926 ntTSL 53.04□□□□□ -1.922e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 LMO7-215ENST00000525107 536 ntTSL 52.85□□□□□ -1.953e-7■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 ITCH-205ENST00000483727 1070 ntTSL 52.32□□□□□ -2.041e-15■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 DMTF1-231ENST00000580803 588 ntTSL 21.9□□□□□ -2.112e-8■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 ITCH-203ENST00000461661 450 ntTSL 51.59□□□□□ -2.151e-15■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.412e-9■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 TNFAIP3-209ENST00000619035 2267 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.342e-9■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 TNFAIP3-206ENST00000612899 4735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.352e-9■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 TNFAIP3-211ENST00000621150 1613 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.392e-9■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 TNFAIP3-201ENST00000237289 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.582e-9■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 TNFAIP3-208ENST00000615468 3818 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.792e-9■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 TNFAIP3-202ENST00000420009 698 ntTSL 310□□□□□ -0.812e-9■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 TNFAIP3-210ENST00000620204 3817 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.872e-9■■■■■ 44.3
RBM22Q9NW64 B2M-207ENST00000559907 499 ntTSL 314.37□□□□□ -0.113e-10■■■■■ 44.2
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RBM22Q9NW64 B2M-208ENST00000559916 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.723e-10■■■■■ 44.2
RBM22Q9NW64 B2M-204ENST00000558401 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.913e-10■■■■■ 44.2
RBM22Q9NW64 B2M-212ENST00000561424 604 ntTSL 38.96□□□□□ -0.983e-10■■■■■ 44.2
RBM22Q9NW64 B2M-206ENST00000559720 1220 ntTSL 58.91□□□□□ -0.983e-10■■■■■ 44.2
RBM22Q9NW64 B2M-203ENST00000557901 407 ntTSL 1 (best)7.99□□□□□ -1.133e-10■■■■■ 44.2
RBM22Q9NW64 B2M-213ENST00000623550 2329 nt6.79□□□□□ -1.323e-10■■■■■ 44.2
RBM22Q9NW64 B2M-201ENST00000349264 732 ntTSL 36.39□□□□□ -1.393e-10■■■■■ 44.2
RBM22Q9NW64 B2M-205ENST00000559220 580 ntTSL 56.13□□□□□ -1.433e-10■■■■■ 44.2
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RBM22Q9NW64 B2M-209ENST00000560556 472 ntTSL 32.83□□□□□ -1.963e-10■■■■■ 44.2
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RBM22Q9NW64 DDX46-210ENST00000513592 571 ntTSL 42.66□□□□□ -1.983e-10■■■■■ 44.1
RBM22Q9NW64 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.315e-21■■■■■ 44.1
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RBM22Q9NW64 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.232e-7■■■■■ 44
RBM22Q9NW64 NFKBID-204ENST00000586361 1399 ntTSL 522.13■■□□□ 1.132e-7■■■■■ 44
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RBM22Q9NW64 NFKBID-208ENST00000590828 1552 ntTSL 1 (best)17.83■□□□□ 0.442e-7■■■■■ 44
RBM22Q9NW64 ANKRD11-207ENST00000562816 573 ntTSL 411.15□□□□□ -0.624e-11■■■■■ 44
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RBM22Q9NW64 AZIN1-202ENST00000347770 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.962e-10■■■■■ 43.9
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RBM22Q9NW64 RNF4-203ENST00000503123 298 ntTSL 58.82□□□□□ -12e-10■■■■■ 43.9
RBM22Q9NW64 RNF4-220ENST00000513578 545 ntTSL 48.53□□□□□ -1.042e-10■■■■■ 43.9
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RBM22Q9NW64 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.32e-10■■■■■ 43.9
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RBM22Q9NW64 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.362e-10■■■■■ 43.9
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RBM22Q9NW64 BRD2-211ENST00000482838 759 ntTSL 26.1□□□□□ -1.432e-10■■■■■ 43.9
RBM22Q9NW64 RNF4-217ENST00000511892 547 ntTSL 45.82□□□□□ -1.482e-10■■■■■ 43.9
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RBM22Q9NW64 NF1-219ENST00000579081 8788 ntTSL 1 (best)5.18□□□□□ -1.582e-10■■■■■ 43.9
RBM22Q9NW64 NF1-216ENST00000495910 8223 ntTSL 25.12□□□□□ -1.592e-10■■■■■ 43.9
RBM22Q9NW64 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.612e-10■■■■■ 43.9
RBM22Q9NW64 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.672e-10■■■■■ 43.9
RBM22Q9NW64 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.712e-10■■■■■ 43.9
RBM22Q9NW64 AZIN1-209ENST00000522311 872 ntTSL 33.74□□□□□ -1.812e-10■■■■■ 43.9
RBM22Q9NW64 RNF4-211ENST00000509206 490 ntTSL 33.63□□□□□ -1.832e-10■■■■■ 43.9
RBM22Q9NW64 NF1-206ENST00000466819 1177 ntTSL 53.44□□□□□ -1.862e-10■■■■■ 43.9
RBM22Q9NW64 AZIN1-208ENST00000521536 680 ntTSL 53.31□□□□□ -1.882e-10■■■■■ 43.9
RBM22Q9NW64 RHEB-203ENST00000470370 501 ntTSL 52.88□□□□□ -1.952e-10■■■■■ 43.9
RBM22Q9NW64 RNF4-219ENST00000513450 416 ntTSL 51.16□□□□□ -2.222e-10■■■■■ 43.9
RBM22Q9NW64 RBM39-220ENST00000455343 441 ntTSL 53.51□□□□□ -1.851e-8■■■■■ 43.8
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RBM22Q9NW64 USP10-213ENST00000566512 575 ntTSL 21.85□□□□□ -2.114e-9■■■■■ 43.8
RBM22Q9NW64 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.658e-7■■■■■ 43.7
RBM22Q9NW64 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.598e-7■■■■■ 43.7
RBM22Q9NW64 PCBP2-212ENST00000548190 581 ntTSL 511.5□□□□□ -0.578e-7■■■■■ 43.7
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