Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUK0

MBNL3, Muscleblind-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBNL3Q9NUK0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MBNL3Q9NUK0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MBNL3Q9NUK0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MBNL3Q9NUK0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MBNL3Q9NUK0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MBNL3Q9NUK0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MBNL3Q9NUK0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MBNL3Q9NUK0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MBNL3Q9NUK0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MBNL3Q9NUK0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MBNL3Q9NUK0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MBNL3Q9NUK0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MBNL3Q9NUK0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MBNL3Q9NUK0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MBNL3Q9NUK0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
MBNL3Q9NUK0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MBNL3Q9NUK0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MBNL3Q9NUK0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MBNL3Q9NUK0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MBNL3Q9NUK0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MBNL3Q9NUK0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MBNL3Q9NUK0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
MBNL3Q9NUK0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
MBNL3Q9NUK0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
MBNL3Q9NUK0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MBNL3Q9NUK0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
MBNL3Q9NUK0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MBNL3Q9NUK0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
MBNL3Q9NUK0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MBNL3Q9NUK0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
MBNL3Q9NUK0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MBNL3Q9NUK0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MBNL3Q9NUK0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MBNL3Q9NUK0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MBNL3Q9NUK0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MBNL3Q9NUK0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MBNL3Q9NUK0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MBNL3Q9NUK0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MBNL3Q9NUK0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MBNL3Q9NUK0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MBNL3Q9NUK0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MBNL3Q9NUK0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MBNL3Q9NUK0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MBNL3Q9NUK0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MBNL3Q9NUK0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MBNL3Q9NUK0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MBNL3Q9NUK0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MBNL3Q9NUK0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MBNL3Q9NUK0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MBNL3Q9NUK0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MBNL3Q9NUK0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MBNL3Q9NUK0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MBNL3Q9NUK0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MBNL3Q9NUK0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MBNL3Q9NUK0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MBNL3Q9NUK0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MBNL3Q9NUK0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MBNL3Q9NUK0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MBNL3Q9NUK0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MBNL3Q9NUK0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MBNL3Q9NUK0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MBNL3Q9NUK0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MBNL3Q9NUK0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MBNL3Q9NUK0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MBNL3Q9NUK0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MBNL3Q9NUK0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MBNL3Q9NUK0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MBNL3Q9NUK0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MBNL3Q9NUK0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MBNL3Q9NUK0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MBNL3Q9NUK0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MBNL3Q9NUK0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MBNL3Q9NUK0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MBNL3Q9NUK0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MBNL3Q9NUK0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MBNL3Q9NUK0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MBNL3Q9NUK0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MBNL3Q9NUK0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MBNL3Q9NUK0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MBNL3Q9NUK0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MBNL3Q9NUK0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MBNL3Q9NUK0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MBNL3Q9NUK0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MBNL3Q9NUK0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MBNL3Q9NUK0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MBNL3Q9NUK0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MBNL3Q9NUK0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MBNL3Q9NUK0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MBNL3Q9NUK0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MBNL3Q9NUK0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MBNL3Q9NUK0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MBNL3Q9NUK0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MBNL3Q9NUK0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MBNL3Q9NUK0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MBNL3Q9NUK0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MBNL3Q9NUK0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MBNL3Q9NUK0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MBNL3Q9NUK0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
MBNL3Q9NUK0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MBNL3Q9NUK0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms