Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTN9

SEMA4G, Semaphorin-4G, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4GQ9NTN9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA4GQ9NTN9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA4GQ9NTN9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA4GQ9NTN9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA4GQ9NTN9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA4GQ9NTN9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA4GQ9NTN9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA4GQ9NTN9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA4GQ9NTN9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA4GQ9NTN9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA4GQ9NTN9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SEMA4GQ9NTN9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA4GQ9NTN9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA4GQ9NTN9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEMA4GQ9NTN9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEMA4GQ9NTN9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEMA4GQ9NTN9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SEMA4GQ9NTN9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SEMA4GQ9NTN9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA4GQ9NTN9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA4GQ9NTN9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA4GQ9NTN9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA4GQ9NTN9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA4GQ9NTN9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA4GQ9NTN9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA4GQ9NTN9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA4GQ9NTN9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA4GQ9NTN9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA4GQ9NTN9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA4GQ9NTN9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA4GQ9NTN9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA4GQ9NTN9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA4GQ9NTN9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEMA4GQ9NTN9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEMA4GQ9NTN9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SEMA4GQ9NTN9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA4GQ9NTN9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA4GQ9NTN9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA4GQ9NTN9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA4GQ9NTN9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA4GQ9NTN9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA4GQ9NTN9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA4GQ9NTN9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA4GQ9NTN9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA4GQ9NTN9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA4GQ9NTN9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA4GQ9NTN9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA4GQ9NTN9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA4GQ9NTN9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA4GQ9NTN9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA4GQ9NTN9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA4GQ9NTN9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA4GQ9NTN9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA4GQ9NTN9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEMA4GQ9NTN9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEMA4GQ9NTN9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEMA4GQ9NTN9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEMA4GQ9NTN9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEMA4GQ9NTN9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SEMA4GQ9NTN9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA4GQ9NTN9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA4GQ9NTN9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA4GQ9NTN9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA4GQ9NTN9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA4GQ9NTN9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA4GQ9NTN9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA4GQ9NTN9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA4GQ9NTN9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA4GQ9NTN9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA4GQ9NTN9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA4GQ9NTN9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA4GQ9NTN9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA4GQ9NTN9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA4GQ9NTN9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA4GQ9NTN9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA4GQ9NTN9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA4GQ9NTN9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA4GQ9NTN9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA4GQ9NTN9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA4GQ9NTN9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA4GQ9NTN9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA4GQ9NTN9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA4GQ9NTN9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA4GQ9NTN9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA4GQ9NTN9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA4GQ9NTN9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA4GQ9NTN9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA4GQ9NTN9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA4GQ9NTN9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA4GQ9NTN9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA4GQ9NTN9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SEMA4GQ9NTN9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA4GQ9NTN9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA4GQ9NTN9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA4GQ9NTN9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA4GQ9NTN9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA4GQ9NTN9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA4GQ9NTN9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA4GQ9NTN9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA4GQ9NTN9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms