Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPMQ9NSP4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CENPMQ9NSP4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CENPMQ9NSP4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPMQ9NSP4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPMQ9NSP4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPMQ9NSP4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPMQ9NSP4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPMQ9NSP4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPMQ9NSP4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPMQ9NSP4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPMQ9NSP4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPMQ9NSP4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPMQ9NSP4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPMQ9NSP4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPMQ9NSP4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPMQ9NSP4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPMQ9NSP4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPMQ9NSP4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPMQ9NSP4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPMQ9NSP4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPMQ9NSP4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPMQ9NSP4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPMQ9NSP4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPMQ9NSP4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPMQ9NSP4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPMQ9NSP4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPMQ9NSP4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPMQ9NSP4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPMQ9NSP4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPMQ9NSP4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPMQ9NSP4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPMQ9NSP4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPMQ9NSP4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPMQ9NSP4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPMQ9NSP4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPMQ9NSP4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPMQ9NSP4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPMQ9NSP4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CENPMQ9NSP4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CENPMQ9NSP4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CENPMQ9NSP4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CENPMQ9NSP4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CENPMQ9NSP4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CENPMQ9NSP4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CENPMQ9NSP4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CENPMQ9NSP4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPMQ9NSP4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPMQ9NSP4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPMQ9NSP4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPMQ9NSP4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPMQ9NSP4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPMQ9NSP4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPMQ9NSP4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPMQ9NSP4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPMQ9NSP4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPMQ9NSP4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPMQ9NSP4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPMQ9NSP4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPMQ9NSP4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPMQ9NSP4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPMQ9NSP4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPMQ9NSP4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPMQ9NSP4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPMQ9NSP4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPMQ9NSP4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPMQ9NSP4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPMQ9NSP4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPMQ9NSP4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPMQ9NSP4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPMQ9NSP4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPMQ9NSP4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPMQ9NSP4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPMQ9NSP4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPMQ9NSP4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPMQ9NSP4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPMQ9NSP4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPMQ9NSP4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPMQ9NSP4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CENPMQ9NSP4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPMQ9NSP4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPMQ9NSP4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPMQ9NSP4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPMQ9NSP4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPMQ9NSP4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPMQ9NSP4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPMQ9NSP4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPMQ9NSP4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPMQ9NSP4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPMQ9NSP4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPMQ9NSP4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPMQ9NSP4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPMQ9NSP4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPMQ9NSP4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPMQ9NSP4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPMQ9NSP4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPMQ9NSP4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPMQ9NSP4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CENPMQ9NSP4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CENPMQ9NSP4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms