Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNTG1Q9NSN8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNTG1Q9NSN8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNTG1Q9NSN8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNTG1Q9NSN8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNTG1Q9NSN8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNTG1Q9NSN8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNTG1Q9NSN8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNTG1Q9NSN8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNTG1Q9NSN8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNTG1Q9NSN8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNTG1Q9NSN8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNTG1Q9NSN8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNTG1Q9NSN8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNTG1Q9NSN8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNTG1Q9NSN8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SNTG1Q9NSN8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNTG1Q9NSN8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNTG1Q9NSN8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SNTG1Q9NSN8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SNTG1Q9NSN8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNTG1Q9NSN8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNTG1Q9NSN8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNTG1Q9NSN8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNTG1Q9NSN8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNTG1Q9NSN8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNTG1Q9NSN8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNTG1Q9NSN8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNTG1Q9NSN8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNTG1Q9NSN8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNTG1Q9NSN8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNTG1Q9NSN8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNTG1Q9NSN8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNTG1Q9NSN8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNTG1Q9NSN8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNTG1Q9NSN8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNTG1Q9NSN8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNTG1Q9NSN8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SNTG1Q9NSN8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNTG1Q9NSN8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNTG1Q9NSN8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNTG1Q9NSN8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNTG1Q9NSN8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNTG1Q9NSN8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNTG1Q9NSN8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNTG1Q9NSN8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNTG1Q9NSN8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNTG1Q9NSN8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNTG1Q9NSN8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNTG1Q9NSN8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNTG1Q9NSN8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNTG1Q9NSN8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNTG1Q9NSN8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNTG1Q9NSN8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNTG1Q9NSN8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNTG1Q9NSN8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNTG1Q9NSN8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNTG1Q9NSN8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SNTG1Q9NSN8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNTG1Q9NSN8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNTG1Q9NSN8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNTG1Q9NSN8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNTG1Q9NSN8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNTG1Q9NSN8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNTG1Q9NSN8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNTG1Q9NSN8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNTG1Q9NSN8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNTG1Q9NSN8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNTG1Q9NSN8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SNTG1Q9NSN8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNTG1Q9NSN8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNTG1Q9NSN8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNTG1Q9NSN8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNTG1Q9NSN8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNTG1Q9NSN8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNTG1Q9NSN8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNTG1Q9NSN8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNTG1Q9NSN8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SNTG1Q9NSN8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SNTG1Q9NSN8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNTG1Q9NSN8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNTG1Q9NSN8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNTG1Q9NSN8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNTG1Q9NSN8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNTG1Q9NSN8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNTG1Q9NSN8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNTG1Q9NSN8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNTG1Q9NSN8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SNTG1Q9NSN8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNTG1Q9NSN8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNTG1Q9NSN8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SNTG1Q9NSN8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNTG1Q9NSN8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNTG1Q9NSN8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNTG1Q9NSN8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNTG1Q9NSN8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNTG1Q9NSN8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNTG1Q9NSN8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNTG1Q9NSN8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNTG1Q9NSN8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms