Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNIP2Q9NS61 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNIP2Q9NS61 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNIP2Q9NS61 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNIP2Q9NS61 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNIP2Q9NS61 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KCNIP2Q9NS61 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNIP2Q9NS61 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNIP2Q9NS61 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNIP2Q9NS61 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNIP2Q9NS61 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNIP2Q9NS61 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNIP2Q9NS61 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNIP2Q9NS61 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNIP2Q9NS61 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KCNIP2Q9NS61 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNIP2Q9NS61 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNIP2Q9NS61 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNIP2Q9NS61 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNIP2Q9NS61 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KCNIP2Q9NS61 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNIP2Q9NS61 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNIP2Q9NS61 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNIP2Q9NS61 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNIP2Q9NS61 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNIP2Q9NS61 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
KCNIP2Q9NS61 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
KCNIP2Q9NS61 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KCNIP2Q9NS61 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KCNIP2Q9NS61 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KCNIP2Q9NS61 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCNIP2Q9NS61 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCNIP2Q9NS61 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCNIP2Q9NS61 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCNIP2Q9NS61 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
KCNIP2Q9NS61 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
KCNIP2Q9NS61 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCNIP2Q9NS61 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCNIP2Q9NS61 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNIP2Q9NS61 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNIP2Q9NS61 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNIP2Q9NS61 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNIP2Q9NS61 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNIP2Q9NS61 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KCNIP2Q9NS61 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNIP2Q9NS61 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNIP2Q9NS61 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNIP2Q9NS61 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNIP2Q9NS61 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNIP2Q9NS61 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNIP2Q9NS61 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNIP2Q9NS61 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNIP2Q9NS61 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNIP2Q9NS61 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KCNIP2Q9NS61 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KCNIP2Q9NS61 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNIP2Q9NS61 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNIP2Q9NS61 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNIP2Q9NS61 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNIP2Q9NS61 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KCNIP2Q9NS61 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNIP2Q9NS61 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNIP2Q9NS61 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNIP2Q9NS61 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNIP2Q9NS61 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNIP2Q9NS61 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNIP2Q9NS61 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KCNIP2Q9NS61 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNIP2Q9NS61 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNIP2Q9NS61 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNIP2Q9NS61 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNIP2Q9NS61 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNIP2Q9NS61 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KCNIP2Q9NS61 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNIP2Q9NS61 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNIP2Q9NS61 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNIP2Q9NS61 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNIP2Q9NS61 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNIP2Q9NS61 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNIP2Q9NS61 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KCNIP2Q9NS61 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNIP2Q9NS61 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNIP2Q9NS61 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNIP2Q9NS61 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KCNIP2Q9NS61 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNIP2Q9NS61 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNIP2Q9NS61 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNIP2Q9NS61 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNIP2Q9NS61 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNIP2Q9NS61 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNIP2Q9NS61 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNIP2Q9NS61 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KCNIP2Q9NS61 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KCNIP2Q9NS61 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
KCNIP2Q9NS61 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNIP2Q9NS61 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNIP2Q9NS61 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNIP2Q9NS61 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNIP2Q9NS61 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNIP2Q9NS61 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms