Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR46

SH3GLB2, Endophilin-B2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GLB2Q9NR46 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SH3GLB2Q9NR46 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SH3GLB2Q9NR46 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SH3GLB2Q9NR46 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SH3GLB2Q9NR46 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SH3GLB2Q9NR46 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SH3GLB2Q9NR46 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SH3GLB2Q9NR46 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SH3GLB2Q9NR46 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SH3GLB2Q9NR46 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SH3GLB2Q9NR46 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SH3GLB2Q9NR46 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SH3GLB2Q9NR46 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SH3GLB2Q9NR46 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SH3GLB2Q9NR46 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SH3GLB2Q9NR46 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SH3GLB2Q9NR46 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SH3GLB2Q9NR46 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SH3GLB2Q9NR46 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SH3GLB2Q9NR46 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SH3GLB2Q9NR46 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SH3GLB2Q9NR46 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SH3GLB2Q9NR46 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SH3GLB2Q9NR46 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SH3GLB2Q9NR46 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SH3GLB2Q9NR46 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SH3GLB2Q9NR46 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SH3GLB2Q9NR46 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SH3GLB2Q9NR46 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SH3GLB2Q9NR46 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SH3GLB2Q9NR46 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SH3GLB2Q9NR46 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SH3GLB2Q9NR46 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SH3GLB2Q9NR46 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SH3GLB2Q9NR46 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SH3GLB2Q9NR46 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SH3GLB2Q9NR46 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SH3GLB2Q9NR46 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SH3GLB2Q9NR46 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SH3GLB2Q9NR46 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SH3GLB2Q9NR46 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SH3GLB2Q9NR46 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SH3GLB2Q9NR46 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SH3GLB2Q9NR46 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SH3GLB2Q9NR46 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SH3GLB2Q9NR46 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SH3GLB2Q9NR46 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SH3GLB2Q9NR46 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SH3GLB2Q9NR46 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SH3GLB2Q9NR46 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SH3GLB2Q9NR46 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SH3GLB2Q9NR46 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SH3GLB2Q9NR46 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SH3GLB2Q9NR46 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SH3GLB2Q9NR46 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SH3GLB2Q9NR46 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SH3GLB2Q9NR46 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SH3GLB2Q9NR46 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SH3GLB2Q9NR46 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SH3GLB2Q9NR46 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SH3GLB2Q9NR46 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SH3GLB2Q9NR46 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SH3GLB2Q9NR46 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SH3GLB2Q9NR46 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SH3GLB2Q9NR46 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SH3GLB2Q9NR46 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SH3GLB2Q9NR46 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SH3GLB2Q9NR46 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SH3GLB2Q9NR46 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SH3GLB2Q9NR46 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SH3GLB2Q9NR46 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SH3GLB2Q9NR46 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SH3GLB2Q9NR46 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SH3GLB2Q9NR46 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SH3GLB2Q9NR46 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SH3GLB2Q9NR46 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SH3GLB2Q9NR46 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SH3GLB2Q9NR46 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SH3GLB2Q9NR46 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SH3GLB2Q9NR46 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SH3GLB2Q9NR46 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SH3GLB2Q9NR46 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SH3GLB2Q9NR46 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SH3GLB2Q9NR46 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SH3GLB2Q9NR46 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SH3GLB2Q9NR46 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SH3GLB2Q9NR46 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SH3GLB2Q9NR46 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SH3GLB2Q9NR46 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SH3GLB2Q9NR46 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SH3GLB2Q9NR46 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SH3GLB2Q9NR46 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SH3GLB2Q9NR46 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SH3GLB2Q9NR46 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SH3GLB2Q9NR46 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SH3GLB2Q9NR46 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SH3GLB2Q9NR46 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SH3GLB2Q9NR46 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SH3GLB2Q9NR46 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SH3GLB2Q9NR46 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 968.5 ms