Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS3

NECTIN3, Nectin-3, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN3Q9NQS3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NECTIN3Q9NQS3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NECTIN3Q9NQS3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NECTIN3Q9NQS3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NECTIN3Q9NQS3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NECTIN3Q9NQS3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NECTIN3Q9NQS3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NECTIN3Q9NQS3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NECTIN3Q9NQS3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NECTIN3Q9NQS3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NECTIN3Q9NQS3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NECTIN3Q9NQS3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NECTIN3Q9NQS3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NECTIN3Q9NQS3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NECTIN3Q9NQS3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NECTIN3Q9NQS3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NECTIN3Q9NQS3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NECTIN3Q9NQS3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NECTIN3Q9NQS3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NECTIN3Q9NQS3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NECTIN3Q9NQS3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NECTIN3Q9NQS3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NECTIN3Q9NQS3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NECTIN3Q9NQS3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NECTIN3Q9NQS3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NECTIN3Q9NQS3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NECTIN3Q9NQS3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NECTIN3Q9NQS3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NECTIN3Q9NQS3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NECTIN3Q9NQS3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NECTIN3Q9NQS3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NECTIN3Q9NQS3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NECTIN3Q9NQS3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NECTIN3Q9NQS3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NECTIN3Q9NQS3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NECTIN3Q9NQS3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NECTIN3Q9NQS3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NECTIN3Q9NQS3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NECTIN3Q9NQS3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NECTIN3Q9NQS3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NECTIN3Q9NQS3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NECTIN3Q9NQS3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NECTIN3Q9NQS3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NECTIN3Q9NQS3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NECTIN3Q9NQS3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NECTIN3Q9NQS3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NECTIN3Q9NQS3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NECTIN3Q9NQS3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NECTIN3Q9NQS3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NECTIN3Q9NQS3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NECTIN3Q9NQS3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NECTIN3Q9NQS3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NECTIN3Q9NQS3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NECTIN3Q9NQS3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NECTIN3Q9NQS3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NECTIN3Q9NQS3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NECTIN3Q9NQS3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NECTIN3Q9NQS3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NECTIN3Q9NQS3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NECTIN3Q9NQS3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NECTIN3Q9NQS3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NECTIN3Q9NQS3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NECTIN3Q9NQS3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NECTIN3Q9NQS3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NECTIN3Q9NQS3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NECTIN3Q9NQS3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NECTIN3Q9NQS3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NECTIN3Q9NQS3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NECTIN3Q9NQS3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NECTIN3Q9NQS3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NECTIN3Q9NQS3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NECTIN3Q9NQS3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NECTIN3Q9NQS3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NECTIN3Q9NQS3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NECTIN3Q9NQS3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NECTIN3Q9NQS3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NECTIN3Q9NQS3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NECTIN3Q9NQS3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NECTIN3Q9NQS3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NECTIN3Q9NQS3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NECTIN3Q9NQS3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NECTIN3Q9NQS3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NECTIN3Q9NQS3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NECTIN3Q9NQS3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NECTIN3Q9NQS3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NECTIN3Q9NQS3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NECTIN3Q9NQS3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NECTIN3Q9NQS3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NECTIN3Q9NQS3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NECTIN3Q9NQS3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NECTIN3Q9NQS3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NECTIN3Q9NQS3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NECTIN3Q9NQS3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NECTIN3Q9NQS3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NECTIN3Q9NQS3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NECTIN3Q9NQS3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NECTIN3Q9NQS3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NECTIN3Q9NQS3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NECTIN3Q9NQS3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
NECTIN3Q9NQS3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms