Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FZD3Q9NPG1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FZD3Q9NPG1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FZD3Q9NPG1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FZD3Q9NPG1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
FZD3Q9NPG1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FZD3Q9NPG1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FZD3Q9NPG1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FZD3Q9NPG1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FZD3Q9NPG1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FZD3Q9NPG1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
FZD3Q9NPG1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FZD3Q9NPG1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FZD3Q9NPG1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FZD3Q9NPG1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FZD3Q9NPG1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FZD3Q9NPG1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FZD3Q9NPG1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FZD3Q9NPG1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FZD3Q9NPG1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FZD3Q9NPG1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FZD3Q9NPG1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FZD3Q9NPG1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FZD3Q9NPG1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FZD3Q9NPG1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FZD3Q9NPG1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FZD3Q9NPG1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FZD3Q9NPG1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
FZD3Q9NPG1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FZD3Q9NPG1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FZD3Q9NPG1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FZD3Q9NPG1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FZD3Q9NPG1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FZD3Q9NPG1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FZD3Q9NPG1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FZD3Q9NPG1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FZD3Q9NPG1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FZD3Q9NPG1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FZD3Q9NPG1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FZD3Q9NPG1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FZD3Q9NPG1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FZD3Q9NPG1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FZD3Q9NPG1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FZD3Q9NPG1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FZD3Q9NPG1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FZD3Q9NPG1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FZD3Q9NPG1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FZD3Q9NPG1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FZD3Q9NPG1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FZD3Q9NPG1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FZD3Q9NPG1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FZD3Q9NPG1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FZD3Q9NPG1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
FZD3Q9NPG1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FZD3Q9NPG1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FZD3Q9NPG1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FZD3Q9NPG1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FZD3Q9NPG1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FZD3Q9NPG1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
FZD3Q9NPG1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
FZD3Q9NPG1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FZD3Q9NPG1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FZD3Q9NPG1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FZD3Q9NPG1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FZD3Q9NPG1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
FZD3Q9NPG1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FZD3Q9NPG1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FZD3Q9NPG1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FZD3Q9NPG1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FZD3Q9NPG1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FZD3Q9NPG1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FZD3Q9NPG1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FZD3Q9NPG1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FZD3Q9NPG1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FZD3Q9NPG1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FZD3Q9NPG1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FZD3Q9NPG1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FZD3Q9NPG1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FZD3Q9NPG1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FZD3Q9NPG1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FZD3Q9NPG1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FZD3Q9NPG1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FZD3Q9NPG1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FZD3Q9NPG1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FZD3Q9NPG1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FZD3Q9NPG1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FZD3Q9NPG1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FZD3Q9NPG1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FZD3Q9NPG1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FZD3Q9NPG1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FZD3Q9NPG1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FZD3Q9NPG1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FZD3Q9NPG1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FZD3Q9NPG1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FZD3Q9NPG1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FZD3Q9NPG1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FZD3Q9NPG1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FZD3Q9NPG1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FZD3Q9NPG1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FZD3Q9NPG1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms