Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6A9

PCNX3, Pecanex-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX3Q9H6A9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCNX3Q9H6A9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCNX3Q9H6A9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCNX3Q9H6A9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCNX3Q9H6A9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCNX3Q9H6A9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCNX3Q9H6A9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCNX3Q9H6A9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCNX3Q9H6A9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCNX3Q9H6A9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCNX3Q9H6A9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCNX3Q9H6A9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCNX3Q9H6A9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCNX3Q9H6A9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCNX3Q9H6A9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCNX3Q9H6A9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCNX3Q9H6A9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCNX3Q9H6A9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PCNX3Q9H6A9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCNX3Q9H6A9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCNX3Q9H6A9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCNX3Q9H6A9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCNX3Q9H6A9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCNX3Q9H6A9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCNX3Q9H6A9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCNX3Q9H6A9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCNX3Q9H6A9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCNX3Q9H6A9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCNX3Q9H6A9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCNX3Q9H6A9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCNX3Q9H6A9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCNX3Q9H6A9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCNX3Q9H6A9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCNX3Q9H6A9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCNX3Q9H6A9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCNX3Q9H6A9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCNX3Q9H6A9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCNX3Q9H6A9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCNX3Q9H6A9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCNX3Q9H6A9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PCNX3Q9H6A9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCNX3Q9H6A9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCNX3Q9H6A9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCNX3Q9H6A9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PCNX3Q9H6A9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCNX3Q9H6A9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCNX3Q9H6A9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCNX3Q9H6A9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCNX3Q9H6A9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCNX3Q9H6A9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCNX3Q9H6A9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCNX3Q9H6A9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCNX3Q9H6A9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCNX3Q9H6A9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCNX3Q9H6A9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCNX3Q9H6A9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCNX3Q9H6A9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCNX3Q9H6A9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PCNX3Q9H6A9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCNX3Q9H6A9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCNX3Q9H6A9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCNX3Q9H6A9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCNX3Q9H6A9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCNX3Q9H6A9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCNX3Q9H6A9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCNX3Q9H6A9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCNX3Q9H6A9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCNX3Q9H6A9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCNX3Q9H6A9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCNX3Q9H6A9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCNX3Q9H6A9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCNX3Q9H6A9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCNX3Q9H6A9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCNX3Q9H6A9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCNX3Q9H6A9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCNX3Q9H6A9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCNX3Q9H6A9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCNX3Q9H6A9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PCNX3Q9H6A9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCNX3Q9H6A9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCNX3Q9H6A9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCNX3Q9H6A9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCNX3Q9H6A9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCNX3Q9H6A9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCNX3Q9H6A9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCNX3Q9H6A9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCNX3Q9H6A9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCNX3Q9H6A9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCNX3Q9H6A9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCNX3Q9H6A9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCNX3Q9H6A9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCNX3Q9H6A9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCNX3Q9H6A9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCNX3Q9H6A9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCNX3Q9H6A9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCNX3Q9H6A9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCNX3Q9H6A9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCNX3Q9H6A9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCNX3Q9H6A9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCNX3Q9H6A9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms