Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3C7

GGNBP2, Gametogenetin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP2Q9H3C7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
GGNBP2Q9H3C7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
GGNBP2Q9H3C7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
GGNBP2Q9H3C7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
GGNBP2Q9H3C7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
GGNBP2Q9H3C7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
GGNBP2Q9H3C7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
GGNBP2Q9H3C7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
GGNBP2Q9H3C7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
GGNBP2Q9H3C7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
GGNBP2Q9H3C7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
GGNBP2Q9H3C7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
GGNBP2Q9H3C7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
GGNBP2Q9H3C7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
GGNBP2Q9H3C7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
GGNBP2Q9H3C7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
GGNBP2Q9H3C7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
GGNBP2Q9H3C7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
GGNBP2Q9H3C7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
GGNBP2Q9H3C7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
GGNBP2Q9H3C7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
GGNBP2Q9H3C7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
GGNBP2Q9H3C7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
GGNBP2Q9H3C7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
GGNBP2Q9H3C7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
GGNBP2Q9H3C7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
GGNBP2Q9H3C7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
GGNBP2Q9H3C7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
GGNBP2Q9H3C7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
GGNBP2Q9H3C7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
GGNBP2Q9H3C7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
GGNBP2Q9H3C7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
GGNBP2Q9H3C7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
GGNBP2Q9H3C7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
GGNBP2Q9H3C7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
GGNBP2Q9H3C7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
GGNBP2Q9H3C7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
GGNBP2Q9H3C7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
GGNBP2Q9H3C7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
GGNBP2Q9H3C7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
GGNBP2Q9H3C7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
GGNBP2Q9H3C7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
GGNBP2Q9H3C7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
GGNBP2Q9H3C7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
GGNBP2Q9H3C7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
GGNBP2Q9H3C7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
GGNBP2Q9H3C7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
GGNBP2Q9H3C7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
GGNBP2Q9H3C7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
GGNBP2Q9H3C7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
GGNBP2Q9H3C7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
GGNBP2Q9H3C7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
GGNBP2Q9H3C7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
GGNBP2Q9H3C7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
GGNBP2Q9H3C7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
GGNBP2Q9H3C7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
GGNBP2Q9H3C7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
GGNBP2Q9H3C7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
GGNBP2Q9H3C7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
GGNBP2Q9H3C7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
GGNBP2Q9H3C7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
GGNBP2Q9H3C7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
GGNBP2Q9H3C7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
GGNBP2Q9H3C7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
GGNBP2Q9H3C7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
GGNBP2Q9H3C7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
GGNBP2Q9H3C7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
GGNBP2Q9H3C7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
GGNBP2Q9H3C7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
GGNBP2Q9H3C7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
GGNBP2Q9H3C7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
GGNBP2Q9H3C7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
GGNBP2Q9H3C7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
GGNBP2Q9H3C7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
GGNBP2Q9H3C7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
GGNBP2Q9H3C7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
GGNBP2Q9H3C7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
GGNBP2Q9H3C7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
GGNBP2Q9H3C7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
GGNBP2Q9H3C7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
GGNBP2Q9H3C7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC33.9■■■■□ 3.02
GGNBP2Q9H3C7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
GGNBP2Q9H3C7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
GGNBP2Q9H3C7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
GGNBP2Q9H3C7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
GGNBP2Q9H3C7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
GGNBP2Q9H3C7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
GGNBP2Q9H3C7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
GGNBP2Q9H3C7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
GGNBP2Q9H3C7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
GGNBP2Q9H3C7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
GGNBP2Q9H3C7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
GGNBP2Q9H3C7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
GGNBP2Q9H3C7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
GGNBP2Q9H3C7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
GGNBP2Q9H3C7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
GGNBP2Q9H3C7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
GGNBP2Q9H3C7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
GGNBP2Q9H3C7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
GGNBP2Q9H3C7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms