Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2L4

TMEM60, Transmembrane protein 60, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM60Q9H2L4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMEM60Q9H2L4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMEM60Q9H2L4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TMEM60Q9H2L4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMEM60Q9H2L4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMEM60Q9H2L4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMEM60Q9H2L4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMEM60Q9H2L4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMEM60Q9H2L4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMEM60Q9H2L4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMEM60Q9H2L4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMEM60Q9H2L4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMEM60Q9H2L4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMEM60Q9H2L4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMEM60Q9H2L4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMEM60Q9H2L4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMEM60Q9H2L4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMEM60Q9H2L4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMEM60Q9H2L4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMEM60Q9H2L4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TMEM60Q9H2L4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMEM60Q9H2L4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMEM60Q9H2L4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMEM60Q9H2L4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMEM60Q9H2L4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMEM60Q9H2L4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMEM60Q9H2L4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMEM60Q9H2L4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMEM60Q9H2L4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM60Q9H2L4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM60Q9H2L4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM60Q9H2L4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM60Q9H2L4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM60Q9H2L4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM60Q9H2L4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM60Q9H2L4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM60Q9H2L4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM60Q9H2L4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM60Q9H2L4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM60Q9H2L4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM60Q9H2L4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM60Q9H2L4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM60Q9H2L4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
TMEM60Q9H2L4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM60Q9H2L4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM60Q9H2L4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM60Q9H2L4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM60Q9H2L4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMEM60Q9H2L4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMEM60Q9H2L4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMEM60Q9H2L4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMEM60Q9H2L4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM60Q9H2L4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM60Q9H2L4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM60Q9H2L4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM60Q9H2L4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM60Q9H2L4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM60Q9H2L4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMEM60Q9H2L4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMEM60Q9H2L4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMEM60Q9H2L4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMEM60Q9H2L4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMEM60Q9H2L4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM60Q9H2L4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM60Q9H2L4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM60Q9H2L4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM60Q9H2L4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM60Q9H2L4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM60Q9H2L4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM60Q9H2L4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TMEM60Q9H2L4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TMEM60Q9H2L4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMEM60Q9H2L4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMEM60Q9H2L4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMEM60Q9H2L4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM60Q9H2L4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM60Q9H2L4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM60Q9H2L4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM60Q9H2L4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM60Q9H2L4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM60Q9H2L4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMEM60Q9H2L4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMEM60Q9H2L4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM60Q9H2L4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM60Q9H2L4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM60Q9H2L4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM60Q9H2L4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM60Q9H2L4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM60Q9H2L4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM60Q9H2L4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM60Q9H2L4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM60Q9H2L4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM60Q9H2L4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM60Q9H2L4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMEM60Q9H2L4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMEM60Q9H2L4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMEM60Q9H2L4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMEM60Q9H2L4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMEM60Q9H2L4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMEM60Q9H2L4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms