Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0Y0

ATG10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG10Q9H0Y0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG10Q9H0Y0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG10Q9H0Y0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG10Q9H0Y0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG10Q9H0Y0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG10Q9H0Y0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG10Q9H0Y0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG10Q9H0Y0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG10Q9H0Y0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG10Q9H0Y0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG10Q9H0Y0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG10Q9H0Y0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG10Q9H0Y0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG10Q9H0Y0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG10Q9H0Y0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG10Q9H0Y0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG10Q9H0Y0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG10Q9H0Y0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG10Q9H0Y0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG10Q9H0Y0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG10Q9H0Y0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG10Q9H0Y0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG10Q9H0Y0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG10Q9H0Y0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG10Q9H0Y0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG10Q9H0Y0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG10Q9H0Y0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG10Q9H0Y0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG10Q9H0Y0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG10Q9H0Y0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG10Q9H0Y0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG10Q9H0Y0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG10Q9H0Y0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG10Q9H0Y0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG10Q9H0Y0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG10Q9H0Y0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG10Q9H0Y0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG10Q9H0Y0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG10Q9H0Y0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG10Q9H0Y0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG10Q9H0Y0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG10Q9H0Y0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG10Q9H0Y0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG10Q9H0Y0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG10Q9H0Y0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG10Q9H0Y0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG10Q9H0Y0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG10Q9H0Y0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG10Q9H0Y0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG10Q9H0Y0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG10Q9H0Y0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG10Q9H0Y0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG10Q9H0Y0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG10Q9H0Y0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG10Q9H0Y0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATG10Q9H0Y0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG10Q9H0Y0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG10Q9H0Y0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG10Q9H0Y0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATG10Q9H0Y0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG10Q9H0Y0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG10Q9H0Y0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG10Q9H0Y0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG10Q9H0Y0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG10Q9H0Y0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG10Q9H0Y0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG10Q9H0Y0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG10Q9H0Y0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG10Q9H0Y0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG10Q9H0Y0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG10Q9H0Y0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG10Q9H0Y0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG10Q9H0Y0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG10Q9H0Y0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG10Q9H0Y0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG10Q9H0Y0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG10Q9H0Y0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG10Q9H0Y0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG10Q9H0Y0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG10Q9H0Y0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG10Q9H0Y0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG10Q9H0Y0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG10Q9H0Y0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG10Q9H0Y0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG10Q9H0Y0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG10Q9H0Y0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATG10Q9H0Y0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATG10Q9H0Y0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
ATG10Q9H0Y0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATG10Q9H0Y0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATG10Q9H0Y0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATG10Q9H0Y0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ATG10Q9H0Y0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG10Q9H0Y0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG10Q9H0Y0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG10Q9H0Y0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG10Q9H0Y0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG10Q9H0Y0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG10Q9H0Y0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG10Q9H0Y0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms