Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0P0

NT5C3A, Cytosolic 5'-nucleotidase 3A, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NT5C3AQ9H0P0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NT5C3AQ9H0P0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NT5C3AQ9H0P0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NT5C3AQ9H0P0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NT5C3AQ9H0P0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NT5C3AQ9H0P0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NT5C3AQ9H0P0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NT5C3AQ9H0P0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NT5C3AQ9H0P0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NT5C3AQ9H0P0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NT5C3AQ9H0P0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NT5C3AQ9H0P0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NT5C3AQ9H0P0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NT5C3AQ9H0P0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NT5C3AQ9H0P0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NT5C3AQ9H0P0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NT5C3AQ9H0P0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NT5C3AQ9H0P0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NT5C3AQ9H0P0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NT5C3AQ9H0P0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NT5C3AQ9H0P0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NT5C3AQ9H0P0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NT5C3AQ9H0P0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NT5C3AQ9H0P0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NT5C3AQ9H0P0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NT5C3AQ9H0P0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NT5C3AQ9H0P0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NT5C3AQ9H0P0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NT5C3AQ9H0P0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NT5C3AQ9H0P0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NT5C3AQ9H0P0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NT5C3AQ9H0P0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NT5C3AQ9H0P0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NT5C3AQ9H0P0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NT5C3AQ9H0P0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NT5C3AQ9H0P0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NT5C3AQ9H0P0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NT5C3AQ9H0P0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NT5C3AQ9H0P0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NT5C3AQ9H0P0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NT5C3AQ9H0P0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NT5C3AQ9H0P0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NT5C3AQ9H0P0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NT5C3AQ9H0P0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NT5C3AQ9H0P0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NT5C3AQ9H0P0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NT5C3AQ9H0P0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NT5C3AQ9H0P0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NT5C3AQ9H0P0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NT5C3AQ9H0P0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NT5C3AQ9H0P0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NT5C3AQ9H0P0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NT5C3AQ9H0P0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NT5C3AQ9H0P0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NT5C3AQ9H0P0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NT5C3AQ9H0P0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NT5C3AQ9H0P0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NT5C3AQ9H0P0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
NT5C3AQ9H0P0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NT5C3AQ9H0P0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NT5C3AQ9H0P0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NT5C3AQ9H0P0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NT5C3AQ9H0P0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NT5C3AQ9H0P0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NT5C3AQ9H0P0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NT5C3AQ9H0P0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NT5C3AQ9H0P0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NT5C3AQ9H0P0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NT5C3AQ9H0P0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NT5C3AQ9H0P0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NT5C3AQ9H0P0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NT5C3AQ9H0P0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NT5C3AQ9H0P0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NT5C3AQ9H0P0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NT5C3AQ9H0P0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NT5C3AQ9H0P0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NT5C3AQ9H0P0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NT5C3AQ9H0P0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NT5C3AQ9H0P0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NT5C3AQ9H0P0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NT5C3AQ9H0P0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NT5C3AQ9H0P0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NT5C3AQ9H0P0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NT5C3AQ9H0P0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
NT5C3AQ9H0P0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NT5C3AQ9H0P0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NT5C3AQ9H0P0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NT5C3AQ9H0P0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NT5C3AQ9H0P0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NT5C3AQ9H0P0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NT5C3AQ9H0P0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NT5C3AQ9H0P0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NT5C3AQ9H0P0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NT5C3AQ9H0P0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NT5C3AQ9H0P0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NT5C3AQ9H0P0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NT5C3AQ9H0P0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NT5C3AQ9H0P0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NT5C3AQ9H0P0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NT5C3AQ9H0P0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms