Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0N0

RAB6C, Ras-related protein Rab-6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ9H0N0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB6CQ9H0N0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB6CQ9H0N0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB6CQ9H0N0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB6CQ9H0N0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB6CQ9H0N0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB6CQ9H0N0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB6CQ9H0N0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB6CQ9H0N0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB6CQ9H0N0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB6CQ9H0N0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB6CQ9H0N0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB6CQ9H0N0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB6CQ9H0N0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB6CQ9H0N0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB6CQ9H0N0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB6CQ9H0N0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB6CQ9H0N0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RAB6CQ9H0N0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB6CQ9H0N0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB6CQ9H0N0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB6CQ9H0N0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB6CQ9H0N0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB6CQ9H0N0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB6CQ9H0N0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB6CQ9H0N0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB6CQ9H0N0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB6CQ9H0N0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB6CQ9H0N0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB6CQ9H0N0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB6CQ9H0N0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB6CQ9H0N0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB6CQ9H0N0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB6CQ9H0N0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB6CQ9H0N0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB6CQ9H0N0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB6CQ9H0N0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB6CQ9H0N0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB6CQ9H0N0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB6CQ9H0N0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB6CQ9H0N0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB6CQ9H0N0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB6CQ9H0N0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB6CQ9H0N0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB6CQ9H0N0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB6CQ9H0N0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB6CQ9H0N0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB6CQ9H0N0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB6CQ9H0N0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB6CQ9H0N0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB6CQ9H0N0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB6CQ9H0N0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB6CQ9H0N0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB6CQ9H0N0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB6CQ9H0N0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB6CQ9H0N0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RAB6CQ9H0N0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAB6CQ9H0N0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
RAB6CQ9H0N0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RAB6CQ9H0N0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RAB6CQ9H0N0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
RAB6CQ9H0N0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RAB6CQ9H0N0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB6CQ9H0N0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB6CQ9H0N0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB6CQ9H0N0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB6CQ9H0N0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB6CQ9H0N0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB6CQ9H0N0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB6CQ9H0N0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB6CQ9H0N0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB6CQ9H0N0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB6CQ9H0N0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB6CQ9H0N0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB6CQ9H0N0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB6CQ9H0N0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB6CQ9H0N0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB6CQ9H0N0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB6CQ9H0N0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB6CQ9H0N0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB6CQ9H0N0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB6CQ9H0N0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RAB6CQ9H0N0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB6CQ9H0N0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB6CQ9H0N0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB6CQ9H0N0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB6CQ9H0N0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB6CQ9H0N0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB6CQ9H0N0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB6CQ9H0N0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB6CQ9H0N0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB6CQ9H0N0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB6CQ9H0N0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB6CQ9H0N0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB6CQ9H0N0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB6CQ9H0N0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB6CQ9H0N0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB6CQ9H0N0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB6CQ9H0N0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB6CQ9H0N0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms