Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0C3

TMEM117, Transmembrane protein 117, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM117Q9H0C3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM117Q9H0C3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM117Q9H0C3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM117Q9H0C3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TMEM117Q9H0C3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMEM117Q9H0C3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMEM117Q9H0C3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMEM117Q9H0C3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TMEM117Q9H0C3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMEM117Q9H0C3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TMEM117Q9H0C3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM117Q9H0C3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM117Q9H0C3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM117Q9H0C3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM117Q9H0C3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TMEM117Q9H0C3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM117Q9H0C3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM117Q9H0C3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TMEM117Q9H0C3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TMEM117Q9H0C3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
TMEM117Q9H0C3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TMEM117Q9H0C3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM117Q9H0C3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM117Q9H0C3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMEM117Q9H0C3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMEM117Q9H0C3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMEM117Q9H0C3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TMEM117Q9H0C3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMEM117Q9H0C3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TMEM117Q9H0C3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMEM117Q9H0C3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TMEM117Q9H0C3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMEM117Q9H0C3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TMEM117Q9H0C3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMEM117Q9H0C3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMEM117Q9H0C3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMEM117Q9H0C3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMEM117Q9H0C3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMEM117Q9H0C3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMEM117Q9H0C3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMEM117Q9H0C3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMEM117Q9H0C3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMEM117Q9H0C3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM117Q9H0C3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM117Q9H0C3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM117Q9H0C3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM117Q9H0C3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM117Q9H0C3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM117Q9H0C3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM117Q9H0C3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMEM117Q9H0C3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMEM117Q9H0C3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMEM117Q9H0C3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMEM117Q9H0C3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TMEM117Q9H0C3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TMEM117Q9H0C3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TMEM117Q9H0C3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMEM117Q9H0C3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMEM117Q9H0C3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM117Q9H0C3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM117Q9H0C3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM117Q9H0C3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM117Q9H0C3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM117Q9H0C3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM117Q9H0C3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM117Q9H0C3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM117Q9H0C3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM117Q9H0C3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM117Q9H0C3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM117Q9H0C3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM117Q9H0C3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM117Q9H0C3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM117Q9H0C3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM117Q9H0C3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM117Q9H0C3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM117Q9H0C3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM117Q9H0C3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMEM117Q9H0C3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMEM117Q9H0C3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TMEM117Q9H0C3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMEM117Q9H0C3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMEM117Q9H0C3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TMEM117Q9H0C3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TMEM117Q9H0C3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TMEM117Q9H0C3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM117Q9H0C3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM117Q9H0C3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM117Q9H0C3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM117Q9H0C3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM117Q9H0C3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM117Q9H0C3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM117Q9H0C3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM117Q9H0C3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM117Q9H0C3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM117Q9H0C3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM117Q9H0C3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM117Q9H0C3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM117Q9H0C3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM117Q9H0C3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM117Q9H0C3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms