Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
UBE2OQ9C0C9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
UBE2OQ9C0C9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
UBE2OQ9C0C9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
UBE2OQ9C0C9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
UBE2OQ9C0C9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
UBE2OQ9C0C9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
UBE2OQ9C0C9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
UBE2OQ9C0C9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
UBE2OQ9C0C9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
UBE2OQ9C0C9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
UBE2OQ9C0C9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
UBE2OQ9C0C9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
UBE2OQ9C0C9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
UBE2OQ9C0C9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
UBE2OQ9C0C9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
UBE2OQ9C0C9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
UBE2OQ9C0C9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
UBE2OQ9C0C9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
UBE2OQ9C0C9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
UBE2OQ9C0C9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
UBE2OQ9C0C9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
UBE2OQ9C0C9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
UBE2OQ9C0C9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
UBE2OQ9C0C9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
UBE2OQ9C0C9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
UBE2OQ9C0C9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
UBE2OQ9C0C9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
UBE2OQ9C0C9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
UBE2OQ9C0C9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
UBE2OQ9C0C9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
UBE2OQ9C0C9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
UBE2OQ9C0C9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
UBE2OQ9C0C9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
UBE2OQ9C0C9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
UBE2OQ9C0C9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
UBE2OQ9C0C9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
UBE2OQ9C0C9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
UBE2OQ9C0C9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UBE2OQ9C0C9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
UBE2OQ9C0C9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBE2OQ9C0C9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
UBE2OQ9C0C9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
UBE2OQ9C0C9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
UBE2OQ9C0C9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
UBE2OQ9C0C9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
UBE2OQ9C0C9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
UBE2OQ9C0C9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
UBE2OQ9C0C9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
UBE2OQ9C0C9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
UBE2OQ9C0C9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
UBE2OQ9C0C9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
UBE2OQ9C0C9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
UBE2OQ9C0C9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
UBE2OQ9C0C9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
UBE2OQ9C0C9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBE2OQ9C0C9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBE2OQ9C0C9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBE2OQ9C0C9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBE2OQ9C0C9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
UBE2OQ9C0C9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBE2OQ9C0C9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
UBE2OQ9C0C9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBE2OQ9C0C9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBE2OQ9C0C9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
UBE2OQ9C0C9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
UBE2OQ9C0C9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
UBE2OQ9C0C9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
UBE2OQ9C0C9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
UBE2OQ9C0C9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
UBE2OQ9C0C9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
UBE2OQ9C0C9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
UBE2OQ9C0C9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBE2OQ9C0C9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBE2OQ9C0C9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBE2OQ9C0C9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBE2OQ9C0C9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBE2OQ9C0C9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBE2OQ9C0C9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBE2OQ9C0C9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBE2OQ9C0C9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBE2OQ9C0C9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBE2OQ9C0C9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBE2OQ9C0C9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBE2OQ9C0C9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
UBE2OQ9C0C9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBE2OQ9C0C9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBE2OQ9C0C9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBE2OQ9C0C9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBE2OQ9C0C9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBE2OQ9C0C9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBE2OQ9C0C9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBE2OQ9C0C9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBE2OQ9C0C9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
UBE2OQ9C0C9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBE2OQ9C0C9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBE2OQ9C0C9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBE2OQ9C0C9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
UBE2OQ9C0C9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
UBE2OQ9C0C9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.8 ms