Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZS1

FOXP3, Forkhead box protein P3, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP3Q9BZS1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXP3Q9BZS1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXP3Q9BZS1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXP3Q9BZS1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXP3Q9BZS1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXP3Q9BZS1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXP3Q9BZS1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXP3Q9BZS1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXP3Q9BZS1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXP3Q9BZS1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXP3Q9BZS1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXP3Q9BZS1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXP3Q9BZS1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXP3Q9BZS1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXP3Q9BZS1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXP3Q9BZS1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXP3Q9BZS1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXP3Q9BZS1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXP3Q9BZS1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXP3Q9BZS1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXP3Q9BZS1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FOXP3Q9BZS1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
FOXP3Q9BZS1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXP3Q9BZS1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXP3Q9BZS1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXP3Q9BZS1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXP3Q9BZS1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOXP3Q9BZS1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOXP3Q9BZS1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOXP3Q9BZS1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOXP3Q9BZS1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOXP3Q9BZS1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOXP3Q9BZS1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FOXP3Q9BZS1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOXP3Q9BZS1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOXP3Q9BZS1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FOXP3Q9BZS1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXP3Q9BZS1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXP3Q9BZS1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXP3Q9BZS1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXP3Q9BZS1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXP3Q9BZS1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXP3Q9BZS1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXP3Q9BZS1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
FOXP3Q9BZS1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOXP3Q9BZS1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
FOXP3Q9BZS1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOXP3Q9BZS1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOXP3Q9BZS1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
FOXP3Q9BZS1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOXP3Q9BZS1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FOXP3Q9BZS1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FOXP3Q9BZS1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FOXP3Q9BZS1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FOXP3Q9BZS1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
FOXP3Q9BZS1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOXP3Q9BZS1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOXP3Q9BZS1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
FOXP3Q9BZS1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
FOXP3Q9BZS1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
FOXP3Q9BZS1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXP3Q9BZS1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXP3Q9BZS1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXP3Q9BZS1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXP3Q9BZS1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXP3Q9BZS1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXP3Q9BZS1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXP3Q9BZS1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXP3Q9BZS1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXP3Q9BZS1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXP3Q9BZS1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXP3Q9BZS1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXP3Q9BZS1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXP3Q9BZS1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXP3Q9BZS1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOXP3Q9BZS1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOXP3Q9BZS1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
FOXP3Q9BZS1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXP3Q9BZS1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXP3Q9BZS1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXP3Q9BZS1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXP3Q9BZS1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXP3Q9BZS1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXP3Q9BZS1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXP3Q9BZS1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOXP3Q9BZS1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOXP3Q9BZS1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOXP3Q9BZS1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOXP3Q9BZS1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOXP3Q9BZS1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOXP3Q9BZS1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOXP3Q9BZS1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOXP3Q9BZS1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOXP3Q9BZS1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOXP3Q9BZS1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOXP3Q9BZS1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOXP3Q9BZS1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
FOXP3Q9BZS1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOXP3Q9BZS1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOXP3Q9BZS1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms