Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDAC8Q9BY41 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HDAC8Q9BY41 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC8Q9BY41 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC8Q9BY41 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC8Q9BY41 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HDAC8Q9BY41 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HDAC8Q9BY41 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC8Q9BY41 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC8Q9BY41 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC8Q9BY41 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC8Q9BY41 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC8Q9BY41 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HDAC8Q9BY41 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC8Q9BY41 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC8Q9BY41 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC8Q9BY41 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC8Q9BY41 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC8Q9BY41 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC8Q9BY41 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC8Q9BY41 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HDAC8Q9BY41 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC8Q9BY41 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC8Q9BY41 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HDAC8Q9BY41 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC8Q9BY41 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC8Q9BY41 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC8Q9BY41 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC8Q9BY41 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HDAC8Q9BY41 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC8Q9BY41 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC8Q9BY41 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC8Q9BY41 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC8Q9BY41 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HDAC8Q9BY41 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC8Q9BY41 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC8Q9BY41 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC8Q9BY41 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HDAC8Q9BY41 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HDAC8Q9BY41 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
HDAC8Q9BY41 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HDAC8Q9BY41 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC8Q9BY41 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC8Q9BY41 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC8Q9BY41 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC8Q9BY41 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC8Q9BY41 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC8Q9BY41 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC8Q9BY41 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC8Q9BY41 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HDAC8Q9BY41 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC8Q9BY41 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC8Q9BY41 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HDAC8Q9BY41 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC8Q9BY41 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC8Q9BY41 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC8Q9BY41 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC8Q9BY41 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC8Q9BY41 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HDAC8Q9BY41 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDAC8Q9BY41 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HDAC8Q9BY41 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HDAC8Q9BY41 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC8Q9BY41 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC8Q9BY41 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC8Q9BY41 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC8Q9BY41 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC8Q9BY41 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HDAC8Q9BY41 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC8Q9BY41 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC8Q9BY41 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC8Q9BY41 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC8Q9BY41 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC8Q9BY41 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC8Q9BY41 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HDAC8Q9BY41 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC8Q9BY41 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC8Q9BY41 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC8Q9BY41 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC8Q9BY41 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HDAC8Q9BY41 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC8Q9BY41 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC8Q9BY41 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HDAC8Q9BY41 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC8Q9BY41 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC8Q9BY41 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC8Q9BY41 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC8Q9BY41 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC8Q9BY41 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC8Q9BY41 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HDAC8Q9BY41 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HDAC8Q9BY41 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC8Q9BY41 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HDAC8Q9BY41 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC8Q9BY41 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC8Q9BY41 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC8Q9BY41 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC8Q9BY41 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC8Q9BY41 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HDAC8Q9BY41 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms