Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY5

CAPS2, Calcyphosin-2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPS2Q9BXY5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPS2Q9BXY5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPS2Q9BXY5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAPS2Q9BXY5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPS2Q9BXY5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPS2Q9BXY5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPS2Q9BXY5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPS2Q9BXY5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPS2Q9BXY5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPS2Q9BXY5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPS2Q9BXY5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPS2Q9BXY5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPS2Q9BXY5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPS2Q9BXY5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPS2Q9BXY5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPS2Q9BXY5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPS2Q9BXY5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPS2Q9BXY5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPS2Q9BXY5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPS2Q9BXY5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPS2Q9BXY5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPS2Q9BXY5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPS2Q9BXY5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPS2Q9BXY5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPS2Q9BXY5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPS2Q9BXY5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPS2Q9BXY5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPS2Q9BXY5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPS2Q9BXY5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPS2Q9BXY5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CAPS2Q9BXY5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPS2Q9BXY5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPS2Q9BXY5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPS2Q9BXY5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPS2Q9BXY5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPS2Q9BXY5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPS2Q9BXY5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPS2Q9BXY5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPS2Q9BXY5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPS2Q9BXY5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPS2Q9BXY5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPS2Q9BXY5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPS2Q9BXY5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPS2Q9BXY5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPS2Q9BXY5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPS2Q9BXY5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPS2Q9BXY5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPS2Q9BXY5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPS2Q9BXY5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPS2Q9BXY5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPS2Q9BXY5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPS2Q9BXY5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPS2Q9BXY5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPS2Q9BXY5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPS2Q9BXY5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPS2Q9BXY5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPS2Q9BXY5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPS2Q9BXY5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPS2Q9BXY5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CAPS2Q9BXY5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPS2Q9BXY5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPS2Q9BXY5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPS2Q9BXY5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPS2Q9BXY5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPS2Q9BXY5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPS2Q9BXY5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPS2Q9BXY5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPS2Q9BXY5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPS2Q9BXY5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPS2Q9BXY5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPS2Q9BXY5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPS2Q9BXY5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPS2Q9BXY5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPS2Q9BXY5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPS2Q9BXY5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPS2Q9BXY5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPS2Q9BXY5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPS2Q9BXY5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPS2Q9BXY5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPS2Q9BXY5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPS2Q9BXY5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPS2Q9BXY5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPS2Q9BXY5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPS2Q9BXY5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPS2Q9BXY5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CAPS2Q9BXY5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPS2Q9BXY5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPS2Q9BXY5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPS2Q9BXY5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPS2Q9BXY5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPS2Q9BXY5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPS2Q9BXY5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPS2Q9BXY5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPS2Q9BXY5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPS2Q9BXY5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPS2Q9BXY5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPS2Q9BXY5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPS2Q9BXY5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPS2Q9BXY5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPS2Q9BXY5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms