Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BBS2Q9BXC9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BBS2Q9BXC9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BBS2Q9BXC9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BBS2Q9BXC9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BBS2Q9BXC9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BBS2Q9BXC9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BBS2Q9BXC9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BBS2Q9BXC9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BBS2Q9BXC9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BBS2Q9BXC9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BBS2Q9BXC9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BBS2Q9BXC9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BBS2Q9BXC9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BBS2Q9BXC9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BBS2Q9BXC9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BBS2Q9BXC9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
BBS2Q9BXC9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BBS2Q9BXC9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BBS2Q9BXC9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BBS2Q9BXC9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BBS2Q9BXC9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BBS2Q9BXC9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BBS2Q9BXC9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
BBS2Q9BXC9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BBS2Q9BXC9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BBS2Q9BXC9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BBS2Q9BXC9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BBS2Q9BXC9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BBS2Q9BXC9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BBS2Q9BXC9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BBS2Q9BXC9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BBS2Q9BXC9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BBS2Q9BXC9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BBS2Q9BXC9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BBS2Q9BXC9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BBS2Q9BXC9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BBS2Q9BXC9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BBS2Q9BXC9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BBS2Q9BXC9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BBS2Q9BXC9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BBS2Q9BXC9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BBS2Q9BXC9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BBS2Q9BXC9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BBS2Q9BXC9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BBS2Q9BXC9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BBS2Q9BXC9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BBS2Q9BXC9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BBS2Q9BXC9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
BBS2Q9BXC9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BBS2Q9BXC9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BBS2Q9BXC9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BBS2Q9BXC9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BBS2Q9BXC9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BBS2Q9BXC9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BBS2Q9BXC9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
BBS2Q9BXC9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
BBS2Q9BXC9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BBS2Q9BXC9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
BBS2Q9BXC9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BBS2Q9BXC9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BBS2Q9BXC9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BBS2Q9BXC9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BBS2Q9BXC9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BBS2Q9BXC9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BBS2Q9BXC9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BBS2Q9BXC9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BBS2Q9BXC9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BBS2Q9BXC9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BBS2Q9BXC9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BBS2Q9BXC9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BBS2Q9BXC9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BBS2Q9BXC9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
BBS2Q9BXC9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BBS2Q9BXC9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BBS2Q9BXC9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BBS2Q9BXC9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BBS2Q9BXC9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BBS2Q9BXC9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BBS2Q9BXC9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BBS2Q9BXC9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
BBS2Q9BXC9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BBS2Q9BXC9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BBS2Q9BXC9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BBS2Q9BXC9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BBS2Q9BXC9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BBS2Q9BXC9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BBS2Q9BXC9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BBS2Q9BXC9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BBS2Q9BXC9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
BBS2Q9BXC9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BBS2Q9BXC9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BBS2Q9BXC9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BBS2Q9BXC9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BBS2Q9BXC9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BBS2Q9BXC9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BBS2Q9BXC9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BBS2Q9BXC9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
BBS2Q9BXC9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BBS2Q9BXC9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms