Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
BRIP1Q9BX63 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
BRIP1Q9BX63 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
BRIP1Q9BX63 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
BRIP1Q9BX63 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
BRIP1Q9BX63 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
BRIP1Q9BX63 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
BRIP1Q9BX63 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
BRIP1Q9BX63 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
BRIP1Q9BX63 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
BRIP1Q9BX63 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
BRIP1Q9BX63 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
BRIP1Q9BX63 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
BRIP1Q9BX63 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
BRIP1Q9BX63 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
BRIP1Q9BX63 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
BRIP1Q9BX63 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
BRIP1Q9BX63 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
BRIP1Q9BX63 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
BRIP1Q9BX63 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
BRIP1Q9BX63 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
BRIP1Q9BX63 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
BRIP1Q9BX63 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
BRIP1Q9BX63 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
BRIP1Q9BX63 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
BRIP1Q9BX63 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
BRIP1Q9BX63 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
BRIP1Q9BX63 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
BRIP1Q9BX63 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
BRIP1Q9BX63 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
BRIP1Q9BX63 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
BRIP1Q9BX63 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
BRIP1Q9BX63 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
BRIP1Q9BX63 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
BRIP1Q9BX63 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
BRIP1Q9BX63 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
BRIP1Q9BX63 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
BRIP1Q9BX63 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
BRIP1Q9BX63 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
BRIP1Q9BX63 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
BRIP1Q9BX63 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
BRIP1Q9BX63 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
BRIP1Q9BX63 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
BRIP1Q9BX63 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
BRIP1Q9BX63 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
BRIP1Q9BX63 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
BRIP1Q9BX63 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
BRIP1Q9BX63 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
BRIP1Q9BX63 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
BRIP1Q9BX63 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
BRIP1Q9BX63 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
BRIP1Q9BX63 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
BRIP1Q9BX63 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
BRIP1Q9BX63 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
BRIP1Q9BX63 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
BRIP1Q9BX63 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
BRIP1Q9BX63 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
BRIP1Q9BX63 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
BRIP1Q9BX63 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
BRIP1Q9BX63 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
BRIP1Q9BX63 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
BRIP1Q9BX63 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
BRIP1Q9BX63 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
BRIP1Q9BX63 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
BRIP1Q9BX63 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
BRIP1Q9BX63 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
BRIP1Q9BX63 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
BRIP1Q9BX63 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
BRIP1Q9BX63 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
BRIP1Q9BX63 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
BRIP1Q9BX63 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
BRIP1Q9BX63 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
BRIP1Q9BX63 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
BRIP1Q9BX63 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
BRIP1Q9BX63 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
BRIP1Q9BX63 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
BRIP1Q9BX63 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
BRIP1Q9BX63 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
BRIP1Q9BX63 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.28■■■□□ 2.6
BRIP1Q9BX63 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
BRIP1Q9BX63 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
BRIP1Q9BX63 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
BRIP1Q9BX63 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
BRIP1Q9BX63 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
BRIP1Q9BX63 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
BRIP1Q9BX63 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
BRIP1Q9BX63 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
BRIP1Q9BX63 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
BRIP1Q9BX63 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
BRIP1Q9BX63 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
BRIP1Q9BX63 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
BRIP1Q9BX63 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
BRIP1Q9BX63 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
BRIP1Q9BX63 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC31.25■■■□□ 2.59
BRIP1Q9BX63 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
BRIP1Q9BX63 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
BRIP1Q9BX63 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
BRIP1Q9BX63 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
BRIP1Q9BX63 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
BRIP1Q9BX63 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms