Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX40

LSM14B, Protein LSM14 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM14BQ9BX40 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LSM14BQ9BX40 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LSM14BQ9BX40 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LSM14BQ9BX40 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LSM14BQ9BX40 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LSM14BQ9BX40 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LSM14BQ9BX40 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LSM14BQ9BX40 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LSM14BQ9BX40 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LSM14BQ9BX40 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LSM14BQ9BX40 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LSM14BQ9BX40 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LSM14BQ9BX40 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LSM14BQ9BX40 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LSM14BQ9BX40 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LSM14BQ9BX40 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LSM14BQ9BX40 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LSM14BQ9BX40 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LSM14BQ9BX40 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LSM14BQ9BX40 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LSM14BQ9BX40 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LSM14BQ9BX40 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LSM14BQ9BX40 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LSM14BQ9BX40 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LSM14BQ9BX40 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LSM14BQ9BX40 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LSM14BQ9BX40 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LSM14BQ9BX40 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LSM14BQ9BX40 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LSM14BQ9BX40 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LSM14BQ9BX40 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LSM14BQ9BX40 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LSM14BQ9BX40 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LSM14BQ9BX40 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LSM14BQ9BX40 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LSM14BQ9BX40 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LSM14BQ9BX40 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LSM14BQ9BX40 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LSM14BQ9BX40 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LSM14BQ9BX40 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LSM14BQ9BX40 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LSM14BQ9BX40 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LSM14BQ9BX40 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LSM14BQ9BX40 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
LSM14BQ9BX40 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LSM14BQ9BX40 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LSM14BQ9BX40 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LSM14BQ9BX40 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LSM14BQ9BX40 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LSM14BQ9BX40 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LSM14BQ9BX40 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LSM14BQ9BX40 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LSM14BQ9BX40 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LSM14BQ9BX40 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LSM14BQ9BX40 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
LSM14BQ9BX40 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LSM14BQ9BX40 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LSM14BQ9BX40 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LSM14BQ9BX40 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LSM14BQ9BX40 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LSM14BQ9BX40 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LSM14BQ9BX40 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LSM14BQ9BX40 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LSM14BQ9BX40 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LSM14BQ9BX40 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LSM14BQ9BX40 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LSM14BQ9BX40 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LSM14BQ9BX40 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LSM14BQ9BX40 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LSM14BQ9BX40 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LSM14BQ9BX40 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LSM14BQ9BX40 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LSM14BQ9BX40 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LSM14BQ9BX40 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LSM14BQ9BX40 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LSM14BQ9BX40 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LSM14BQ9BX40 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
LSM14BQ9BX40 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LSM14BQ9BX40 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LSM14BQ9BX40 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
LSM14BQ9BX40 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LSM14BQ9BX40 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LSM14BQ9BX40 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LSM14BQ9BX40 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LSM14BQ9BX40 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LSM14BQ9BX40 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LSM14BQ9BX40 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LSM14BQ9BX40 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LSM14BQ9BX40 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
LSM14BQ9BX40 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
LSM14BQ9BX40 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LSM14BQ9BX40 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LSM14BQ9BX40 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LSM14BQ9BX40 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LSM14BQ9BX40 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LSM14BQ9BX40 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LSM14BQ9BX40 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LSM14BQ9BX40 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LSM14BQ9BX40 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
LSM14BQ9BX40 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms