Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVC3

DSCC1, Sister chromatid cohesion protein DCC1, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSCC1Q9BVC3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
DSCC1Q9BVC3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
DSCC1Q9BVC3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
DSCC1Q9BVC3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
DSCC1Q9BVC3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
DSCC1Q9BVC3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
DSCC1Q9BVC3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
DSCC1Q9BVC3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
DSCC1Q9BVC3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
DSCC1Q9BVC3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
DSCC1Q9BVC3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
DSCC1Q9BVC3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
DSCC1Q9BVC3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
DSCC1Q9BVC3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
DSCC1Q9BVC3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
DSCC1Q9BVC3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
DSCC1Q9BVC3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
DSCC1Q9BVC3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
DSCC1Q9BVC3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
DSCC1Q9BVC3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
DSCC1Q9BVC3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
DSCC1Q9BVC3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.37
DSCC1Q9BVC3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
DSCC1Q9BVC3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
DSCC1Q9BVC3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
DSCC1Q9BVC3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
DSCC1Q9BVC3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
DSCC1Q9BVC3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
DSCC1Q9BVC3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
DSCC1Q9BVC3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
DSCC1Q9BVC3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
DSCC1Q9BVC3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
DSCC1Q9BVC3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
DSCC1Q9BVC3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
DSCC1Q9BVC3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
DSCC1Q9BVC3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
DSCC1Q9BVC3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
DSCC1Q9BVC3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
DSCC1Q9BVC3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
DSCC1Q9BVC3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
DSCC1Q9BVC3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
DSCC1Q9BVC3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
DSCC1Q9BVC3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
DSCC1Q9BVC3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
DSCC1Q9BVC3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
DSCC1Q9BVC3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
DSCC1Q9BVC3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
DSCC1Q9BVC3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
DSCC1Q9BVC3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
DSCC1Q9BVC3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
DSCC1Q9BVC3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
DSCC1Q9BVC3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
DSCC1Q9BVC3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
DSCC1Q9BVC3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
DSCC1Q9BVC3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
DSCC1Q9BVC3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
DSCC1Q9BVC3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
DSCC1Q9BVC3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
DSCC1Q9BVC3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
DSCC1Q9BVC3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
DSCC1Q9BVC3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
DSCC1Q9BVC3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
DSCC1Q9BVC3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
DSCC1Q9BVC3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
DSCC1Q9BVC3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
DSCC1Q9BVC3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
DSCC1Q9BVC3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
DSCC1Q9BVC3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
DSCC1Q9BVC3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
DSCC1Q9BVC3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
DSCC1Q9BVC3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
DSCC1Q9BVC3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
DSCC1Q9BVC3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
DSCC1Q9BVC3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
DSCC1Q9BVC3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
DSCC1Q9BVC3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
DSCC1Q9BVC3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
DSCC1Q9BVC3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
DSCC1Q9BVC3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
DSCC1Q9BVC3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
DSCC1Q9BVC3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
DSCC1Q9BVC3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
DSCC1Q9BVC3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
DSCC1Q9BVC3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
DSCC1Q9BVC3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
DSCC1Q9BVC3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
DSCC1Q9BVC3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
DSCC1Q9BVC3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
DSCC1Q9BVC3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
DSCC1Q9BVC3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
DSCC1Q9BVC3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
DSCC1Q9BVC3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
DSCC1Q9BVC3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
DSCC1Q9BVC3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
DSCC1Q9BVC3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
DSCC1Q9BVC3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
DSCC1Q9BVC3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
DSCC1Q9BVC3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
DSCC1Q9BVC3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
DSCC1Q9BVC3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8885.8 ms